46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2336 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  100 
 
 
332 aa  670    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  47.09 
 
 
335 aa  312  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  49.46 
 
 
336 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 
338 aa  265  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  40.85 
 
 
337 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  25.91 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  30.7 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 
375 aa  96.3  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
368 aa  93.2  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  24.09 
 
 
414 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  22.71 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  22.46 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  24.77 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  28.48 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  26.45 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  25.88 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 
357 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  23.78 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  23.14 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  19.31 
 
 
352 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  24.58 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  20.31 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  19.67 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  20.31 
 
 
341 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  20.31 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  20.31 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  20.31 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  20.31 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  20.31 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  20.31 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  19.92 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  19.92 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  21.45 
 
 
340 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 
371 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
371 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  20.93 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  20.99 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  20.52 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  18.64 
 
 
373 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  20.9 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  20.73 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  19.78 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  19.78 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>