48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2318 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
165 aa  339  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  49.69 
 
 
177 aa  180  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  56.79 
 
 
168 aa  177  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  50.91 
 
 
169 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  51.23 
 
 
163 aa  171  3e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  50.31 
 
 
165 aa  167  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.48 
 
 
178 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  48.48 
 
 
185 aa  165  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  52.44 
 
 
168 aa  165  3e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  45.34 
 
 
165 aa  161  4e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  49.7 
 
 
169 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  46.06 
 
 
169 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.58 
 
 
168 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.31 
 
 
170 aa  150  9e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.99 
 
 
162 aa  143  8e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.89 
 
 
158 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  36.53 
 
 
186 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.76 
 
 
170 aa  119  2e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  37.42 
 
 
161 aa  115  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.34057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  114  4e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  35.54 
 
 
169 aa  113  1e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.43 
 
 
173 aa  112  2e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  38.65 
 
 
165 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  33.54 
 
 
171 aa  110  7e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  38.51 
 
 
189 aa  107  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  36.97 
 
 
166 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  38.79 
 
 
192 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  29.78 
 
 
180 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.97 
 
 
199 aa  97.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.94 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.37 
 
 
159 aa  97.4  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  32.92 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  31.93 
 
 
163 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  33.54 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76613e-06 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.06 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  35.76 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.66 
 
 
177 aa  83.2  1e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 
162 aa  82.8  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  34.36 
 
 
166 aa  78.6  4e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.94 
 
 
170 aa  76.3  2e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  34.15 
 
 
162 aa  65.1  4e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  31.82 
 
 
127 aa  63.5  1e-09  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  22.52 
 
 
169 aa  61.2  7e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  20.61 
 
 
172 aa  58.5  4e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  19.87 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  24.07 
 
 
200 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  27.27 
 
 
190 aa  40.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>