More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2175 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
477 aa  955  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
498 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.49 
 
 
468 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
468 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
468 aa  329  8e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  34.18 
 
 
498 aa  305  9e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.79 
 
 
517 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.82 
 
 
493 aa  282  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.55 
 
 
462 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  32.34 
 
 
500 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
547 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  31.17 
 
 
484 aa  254  2e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
477 aa  253  5e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  33.4 
 
 
503 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
477 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.89907e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 
482 aa  247  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 
477 aa  246  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.75529e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 
482 aa  245  1e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  4.87111e-06 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 
482 aa  245  1e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.40701e-06 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
482 aa  245  1e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
482 aa  245  1e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
477 aa  245  1e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16915e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
482 aa  245  1e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  31.93 
 
 
485 aa  245  2e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.5048e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
477 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.21 
 
 
490 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 
461 aa  243  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
478 aa  242  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  32.42 
 
 
482 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
397 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  4.0274e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
520 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  32.14 
 
 
479 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 
477 aa  241  3e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
482 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
482 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
477 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.92 
 
 
477 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 
477 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00804e-08 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
477 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
477 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.61 
 
 
397 aa  235  1e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
477 aa  234  2e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
477 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.96805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  28.78 
 
 
478 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
480 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.5 
 
 
480 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
450 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 
480 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  4.75852e-14 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
383 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  29.11 
 
 
480 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.93 
 
 
483 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 
395 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
480 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
480 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
480 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
480 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.66 
 
 
480 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.66 
 
 
480 aa  227  5e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  30.02 
 
 
480 aa  226  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  33.24 
 
 
426 aa  226  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
398 aa  226  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 
406 aa  226  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  34.56 
 
 
406 aa  226  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
480 aa  226  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 
426 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
398 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 
394 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  29.08 
 
 
480 aa  223  5e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
393 aa  223  5e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 
396 aa  223  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 
416 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
414 aa  222  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
395 aa  222  1e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 
395 aa  221  2e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 
400 aa  221  2e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  32.25 
 
 
402 aa  220  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  33.24 
 
 
400 aa  219  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
477 aa  219  8e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 
394 aa  219  8e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.68 
 
 
477 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.29089e-09 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
398 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
477 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.25 
 
 
402 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.68 
 
 
477 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
477 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.68 
 
 
477 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
477 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  33.06 
 
 
397 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  31.45 
 
 
395 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
481 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  29.05 
 
 
477 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2409  hypothetical protein  31.5 
 
 
456 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 
397 aa  216  1e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 
400 aa  215  2e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  28.54 
 
 
480 aa  214  2e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.14762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.44 
 
 
477 aa  215  2e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2599  hypothetical protein  31.3 
 
 
456 aa  213  5e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.01409e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.13 
 
 
477 aa  213  5e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  2.01635e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 
394 aa  213  5e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  31.3 
 
 
417 aa  213  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>