64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2165 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  32.84 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  31.62 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  26.47 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  31.06 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  30.83 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  29.09 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  24.64 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  27.69 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  28.95 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  29.36 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  25.41 
 
 
292 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3749  hypothetical protein  23.93 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  30.68 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  30.7 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  31.03 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  26.96 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  29.51 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 
96 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  30.33 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  25.96 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  30.34 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  25.6 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  26.09 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  26.27 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  28.43 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  31.68 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  28.83 
 
 
271 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  30.43 
 
 
270 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  31.88 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  29.75 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  28.09 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  28.81 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 
132 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  22.73 
 
 
156 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 
132 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  28.09 
 
 
102 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 
96 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  20.83 
 
 
167 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 
105 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 
115 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  24.79 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  25.3 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  29.09 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  27.38 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  35.94 
 
 
102 aa  41.2  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  24.32 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  32.05 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  30.23 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  23.33 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  30.4 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  31.3 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  26.45 
 
 
146 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  28.89 
 
 
109 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>