More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2127 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 
365 aa  728    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  45.36 
 
 
380 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  45.77 
 
 
378 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  45.5 
 
 
379 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  46.77 
 
 
372 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  44.19 
 
 
387 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  44 
 
 
377 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  43.13 
 
 
365 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  42.02 
 
 
388 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  40.53 
 
 
412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  42.31 
 
 
369 aa  286  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  43.29 
 
 
366 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  42.15 
 
 
366 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  43.72 
 
 
366 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  41.32 
 
 
366 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  40.85 
 
 
378 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  45.9 
 
 
366 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  41.8 
 
 
366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  44.08 
 
 
366 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  43.33 
 
 
373 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  42.27 
 
 
376 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 
371 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 
368 aa  265  8e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  40.33 
 
 
413 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  40.92 
 
 
382 aa  258  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  39.94 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  36.07 
 
 
419 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  41.1 
 
 
369 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  38.86 
 
 
367 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  42.09 
 
 
387 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  39.61 
 
 
363 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  39.39 
 
 
417 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  39.39 
 
 
417 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  39.12 
 
 
374 aa  246  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 
373 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  38.5 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  40.56 
 
 
366 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  40.92 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  39.78 
 
 
371 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  40.38 
 
 
373 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  38.13 
 
 
411 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  37.99 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 
403 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 
390 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 
364 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 
426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 
378 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 
371 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  38.4 
 
 
373 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  42.76 
 
 
384 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 
386 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  43.68 
 
 
423 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  38.27 
 
 
382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 
378 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  38.83 
 
 
374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  38.72 
 
 
367 aa  234  3e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  39.94 
 
 
374 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 
368 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  40.05 
 
 
407 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 
373 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  37.43 
 
 
405 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  32.78 
 
 
438 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.89 
 
 
421 aa  230  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  37.91 
 
 
371 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  37.67 
 
 
374 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  38.61 
 
 
398 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  42.38 
 
 
372 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 
368 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.96 
 
 
371 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  37.46 
 
 
367 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  40.12 
 
 
371 aa  222  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  38.93 
 
 
411 aa  222  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  41.39 
 
 
367 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  41.39 
 
 
367 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  39.17 
 
 
365 aa  222  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  35.46 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  41.06 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  38.44 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  41.06 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  41.06 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  41.06 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  41.06 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  37.06 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  37.05 
 
 
372 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  37.64 
 
 
363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  41.14 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 
357 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  39.13 
 
 
368 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  41.1 
 
 
372 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  39.68 
 
 
361 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  36.77 
 
 
371 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  37.4 
 
 
374 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  37.4 
 
 
374 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  42.91 
 
 
377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  37.78 
 
 
370 aa  215  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 
373 aa  215  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  42.19 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  39.67 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  34.22 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>