More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2090 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
94 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  56.32 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  57.14 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  56.25 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  53.49 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  52.33 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  52.33 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  51.16 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  54.76 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  53.57 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  53.49 
 
 
88 aa  77  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  52.87 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  49.37 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  47.67 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  53.66 
 
 
94 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  50.63 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  52.05 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  47.19 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
105 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  48.84 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  47.19 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  43.48 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  43.48 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  43.02 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  42.22 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  43.48 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  42.39 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  42.39 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  42.39 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  42.39 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  49.35 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  46.67 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  49.35 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  42.39 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  42.39 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0001  30S ribosomal protein S20  41.3 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000133909  decreased coverage  0.0000000319383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.35 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  39.53 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  47.06 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>