More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2064 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 
65 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  69.23 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  69.23 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
67 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  67.69 
 
 
67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  67.69 
 
 
67 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  67.69 
 
 
67 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  67.69 
 
 
67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 
66 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  67.69 
 
 
65 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  67.69 
 
 
65 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  67.69 
 
 
65 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.24 
 
 
66 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 
65 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  72.31 
 
 
66 aa  100  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  72.31 
 
 
66 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
66 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
65 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 
65 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  65.15 
 
 
66 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  69.23 
 
 
65 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  69.7 
 
 
66 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 
66 aa  97.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
65 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 
83 aa  97.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 
66 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.67 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 
65 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  70.59 
 
 
68 aa  96.7  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  65.15 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
65 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
66 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  67.69 
 
 
67 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  67.69 
 
 
67 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000494956  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  94  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  94  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  94  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  94  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
67 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 
66 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
67 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
65 aa  93.6  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
66 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.61 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  67.16 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  68.18 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  65.08 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  63.08 
 
 
65 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  63.08 
 
 
65 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.12 
 
 
66 aa  92  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  67.16 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 
66 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>