More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2057 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
642 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
642 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  653    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 
636 aa  745    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 
636 aa  756    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
640 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
640 aa  680    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
635 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
638 aa  687    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
640 aa  682    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
635 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 
640 aa  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
645 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
638 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1800  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
642 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000021107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
635 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
645 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
640 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
639 aa  772    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
645 aa  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
639 aa  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
645 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
639 aa  768    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
645 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
635 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
637 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
637 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
640 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
644 aa  645    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  49.37 
 
 
638 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
637 aa  680    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
635 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
635 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 
637 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 
584 aa  773    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
635 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
635 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
644 aa  693    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
634 aa  1302    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
643 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
638 aa  724    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
635 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  71.59 
 
 
635 aa  969    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
642 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
639 aa  758    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
641 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 
645 aa  763    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 
644 aa  750    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
642 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
639 aa  772    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
645 aa  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
640 aa  763    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
642 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 
638 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
640 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 
633 aa  883    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
635 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
635 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
640 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
644 aa  725    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
639 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
644 aa  665    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
639 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
669 aa  683    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
636 aa  656    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
635 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 
635 aa  706    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
635 aa  685    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
635 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
640 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 
638 aa  753    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 
645 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
639 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
644 aa  647    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
635 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
659 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
640 aa  668    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
635 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
635 aa  692    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  58.84 
 
 
586 aa  712    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
645 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
643 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
643 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
642 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
635 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
640 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
641 aa  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
645 aa  770    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  66.77 
 
 
635 aa  905    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
642 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
635 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
640 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
635 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 
635 aa  931    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
635 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
644 aa  733    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 
648 aa  700    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 
640 aa  753    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 
636 aa  745    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
643 aa  673    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>