More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1810 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  55.74 
 
 
239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  57.21 
 
 
237 aa  281  9e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  52.81 
 
 
235 aa  271  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  49.12 
 
 
242 aa  249  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  48.67 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  48.67 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  48.66 
 
 
247 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  46.7 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  39.01 
 
 
307 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  44.69 
 
 
240 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  39.64 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  40.91 
 
 
244 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  38.43 
 
 
260 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  38.6 
 
 
282 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  37.73 
 
 
259 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  39.91 
 
 
269 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  35.96 
 
 
292 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  39.65 
 
 
252 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  36.53 
 
 
258 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  37.44 
 
 
255 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 
315 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  37.44 
 
 
255 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  37.72 
 
 
264 aa  151  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  35.93 
 
 
274 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  36.8 
 
 
274 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  36.36 
 
 
274 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  33.77 
 
 
256 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  33.77 
 
 
260 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1750  C32 tRNA thiolase  35.56 
 
 
368 aa  149  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000779647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  35.06 
 
 
274 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  37.39 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  35.06 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  35.59 
 
 
279 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  34.63 
 
 
274 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  36.09 
 
 
314 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2508  putative cell cycle control ATPase  34.22 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  35.93 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  34.2 
 
 
274 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 
319 aa  144  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  34.19 
 
 
274 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  37.07 
 
 
283 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  34.85 
 
 
287 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  34.19 
 
 
274 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  31.97 
 
 
312 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  36.64 
 
 
283 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 
256 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  34.33 
 
 
256 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  36.27 
 
 
199 aa  142  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  35.06 
 
 
274 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 
311 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  30.7 
 
 
280 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 
311 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  35.81 
 
 
276 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  34.32 
 
 
251 aa  141  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  33.62 
 
 
291 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 
314 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  33.62 
 
 
291 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  34.06 
 
 
290 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  33.6 
 
 
297 aa  141  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  34.02 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  35.34 
 
 
302 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  33.78 
 
 
316 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  31.97 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  33.9 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0772  C32 tRNA thiolase  36.18 
 
 
381 aa  139  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26194  normal  0.702409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  34.63 
 
 
331 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  34.2 
 
 
274 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 
311 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  34.2 
 
 
297 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  35.68 
 
 
313 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  34.63 
 
 
331 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  34.55 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 
322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  36.24 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  35.09 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  33.33 
 
 
284 aa  138  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 
311 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  33.48 
 
 
310 aa  138  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 
322 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 
322 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  34.2 
 
 
326 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  34.2 
 
 
331 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 
310 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  33.05 
 
 
310 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  35.93 
 
 
310 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  35.19 
 
 
317 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  35.17 
 
 
313 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0778  C32 tRNA thiolase  36.18 
 
 
381 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.344606  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  35.65 
 
 
313 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  35.65 
 
 
313 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  35.91 
 
 
309 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  35.17 
 
 
313 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  35.65 
 
 
313 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  32.9 
 
 
310 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  34.32 
 
 
318 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 
322 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0387293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>