More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1764 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  58.89 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  46.69 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  48.89 
 
 		 284 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  48.9 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  46.3 
 
 		 283 aa  275  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  45.22 
 
 		 277 aa  254  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  45.09 
 
 		 287 aa  254  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  46.3 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  46.15 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  45.96 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  46.15 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  44.85 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  47.62 
 
 		 279 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  43.8 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  46.32 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  43.22 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  43.8 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  43.49 
 
 		 279 aa  245  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  50.93 
 
 		 279 aa  244  9e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  43.8 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  43.22 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 282 aa  234  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  41.39 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  43.75 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  45.72 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 288 aa  225  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  43.22 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  49.61 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  43.43 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  39.27 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 280 aa  218  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  41.87 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  38.91 
 
 		 288 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  41.24 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  39.27 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  41.97 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  42.75 
 
 		 284 aa  215  7e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  40.07 
 
 		 407 aa  214  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  41.7 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  44.12 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  43.3 
 
 		 299 aa  211  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  39.85 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 355 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  40.14 
 
 		 334 aa  202  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  39.42 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 323 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  39.05 
 
 		 281 aa  198  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  40.66 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  43.22 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 292 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  38.21 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  38.77 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  41.97 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  39.45 
 
 		 296 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  38.77 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  37.94 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 		 292 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  37.94 
 
 		 287 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  38.32 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>