More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1712 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
86 aa  173  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  78.75 
 
 
81 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  75 
 
 
81 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  75 
 
 
90 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  75 
 
 
90 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  75 
 
 
82 aa  129  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 
90 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
81 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  70.37 
 
 
139 aa  127  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  70.89 
 
 
90 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 
88 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  75 
 
 
81 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  75 
 
 
81 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  76.25 
 
 
89 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  69.14 
 
 
88 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 
90 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  68.75 
 
 
91 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  64.2 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  69.23 
 
 
96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  65 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  62.5 
 
 
82 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 
81 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  60 
 
 
91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  60.49 
 
 
81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  64.47 
 
 
81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  61.25 
 
 
85 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  60.76 
 
 
81 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 
90 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  62.03 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  58.75 
 
 
96 aa  107  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  60 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 
90 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
91 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  59.3 
 
 
86 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  59.3 
 
 
86 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
91 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 
85 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  55 
 
 
90 aa  104  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 
91 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 
79 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  58.23 
 
 
82 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  58.97 
 
 
191 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  58.54 
 
 
201 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 
79 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 
192 aa  100  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  55.13 
 
 
95 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  57.32 
 
 
141 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  56.79 
 
 
84 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  56 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 
183 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  60.26 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  55.81 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  55 
 
 
197 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 
95 aa  99  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 
95 aa  99  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  55.13 
 
 
93 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  48.75 
 
 
204 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  53.49 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 
90 aa  97.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 
79 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  58.9 
 
 
80 aa  97.1  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
87 aa  97.1  7e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
131 aa  97.1  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
89 aa  97.1  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
87 aa  96.7  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  56 
 
 
81 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
133 aa  95.9  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  60.26 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 
120 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  56.41 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  56.25 
 
 
186 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  55.13 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>