More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1642 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  44.3 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  43.55 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  45.67 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  45.88 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  41.36 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  40.73 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  41.02 
 
 		 307 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  41.13 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  40.78 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 307 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  40.78 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  40.14 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  41.11 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  49.3 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  38.93 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  41.57 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  47.29 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  39.31 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  42.08 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  36.77 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  41.54 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  38.18 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  36.82 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  38.44 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  38.05 
 
 		 314 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  37.85 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 344 aa  198  9e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  37.59 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  37.94 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  40.21 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  38.44 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  37.76 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  38.93 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  37.79 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  36.88 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  38.26 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  38.26 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1807  tRNA pseudouridine synthase B  43.67 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098308  normal  0.268652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  38.01 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  37.97 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  44.7 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  38.93 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  37.46 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  40.4 
 
 		 294 aa  191  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  36.18 
 
 		 307 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  35.22 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4487  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  34.88 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  42.08 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  35.81 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  39.78 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  35.55 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  38.44 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 		 315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  36.81 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  36.48 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  38.44 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0727  tRNA pseudouridine synthase B  35.92 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3650  tRNA pseudouridine synthase B  37.13 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  36.95 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  36.81 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  36.81 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  36.64 
 
 		 339 aa  188  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>