More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1617 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  100 
 
 
330 aa  666  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.55402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  60.52 
 
 
330 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  60.58 
 
 
330 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.34006e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  60.06 
 
 
328 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.79914e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.09 
 
 
450 aa  338  7e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  4.15693e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.46 
 
 
450 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.42279e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.22 
 
 
329 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  38.63 
 
 
310 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  33.96 
 
 
320 aa  163  4e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  36.16 
 
 
307 aa  156  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  36.16 
 
 
307 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  34.77 
 
 
299 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  36.16 
 
 
307 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.98 
 
 
299 aa  153  3e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  33.66 
 
 
306 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  33.44 
 
 
302 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  34.85 
 
 
300 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  34.46 
 
 
327 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 
300 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  35.43 
 
 
300 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  35.13 
 
 
332 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  32.59 
 
 
298 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.01 
 
 
296 aa  147  2e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  31.15 
 
 
296 aa  147  2e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  32.28 
 
 
298 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  31.83 
 
 
310 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
296 aa  146  4e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
296 aa  146  4e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
296 aa  146  4e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  33.67 
 
 
298 aa  146  4e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.01 
 
 
298 aa  146  4e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  31.63 
 
 
296 aa  147  4e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
296 aa  146  4e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 
302 aa  146  4e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  32.48 
 
 
303 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.35712e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
299 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  33.22 
 
 
294 aa  145  7e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.99 
 
 
298 aa  145  8e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
298 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  32.79 
 
 
293 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.69064e-10 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
296 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 
298 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
298 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 
296 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
298 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  29.77 
 
 
373 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
298 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
302 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
298 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.35 
 
 
296 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  34.53 
 
 
300 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  34.2 
 
 
300 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  34.85 
 
 
309 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  34.2 
 
 
309 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  35.29 
 
 
284 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.69 
 
 
295 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  34.2 
 
 
300 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  34.49 
 
 
317 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 
296 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 
296 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  29.5 
 
 
328 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  34.19 
 
 
295 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 
298 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  33.77 
 
 
298 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  33.23 
 
 
308 aa  143  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  31.95 
 
 
313 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  6.34873e-09 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  34.53 
 
 
309 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  34.6 
 
 
296 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  34.2 
 
 
300 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
298 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.7 
 
 
298 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  32.06 
 
 
329 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.7 
 
 
298 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  32 
 
 
335 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.36 
 
 
296 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  33.11 
 
 
295 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  31.72 
 
 
296 aa  141  1e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  31.48 
 
 
305 aa  141  1e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  31.91 
 
 
294 aa  141  2e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  30.89 
 
 
310 aa  141  2e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  29.62 
 
 
304 aa  140  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.31 
 
 
299 aa  140  2e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  32.57 
 
 
293 aa  141  2e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 
302 aa  141  2e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  32.46 
 
 
314 aa  140  2e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.15 
 
 
298 aa  141  2e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  32.36 
 
 
297 aa  140  2e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  31.41 
 
 
302 aa  140  2e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 
309 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  1.28305e-09 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  32.58 
 
 
297 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
298 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  34.39 
 
 
300 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>