More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1611 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 
875 aa  682    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 
854 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 
859 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  45.38 
 
 
858 aa  768    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  48.73 
 
 
871 aa  816    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 
928 aa  702    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 
891 aa  671    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 
872 aa  738    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  43.76 
 
 
873 aa  746    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 
854 aa  666    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  38.23 
 
 
853 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 
882 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 
892 aa  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  38.92 
 
 
872 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 
858 aa  671    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 
855 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 
856 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  38.81 
 
 
853 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  44.68 
 
 
892 aa  762    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  44.78 
 
 
890 aa  763    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 
894 aa  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 
856 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 
858 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 
823 aa  658    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 
871 aa  671    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  37.94 
 
 
851 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 
881 aa  736    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  56.21 
 
 
932 aa  907    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  43.32 
 
 
881 aa  745    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  45.97 
 
 
900 aa  762    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 
872 aa  738    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 
872 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 
854 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
863 aa  672    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.49 
 
 
863 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 
855 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  44.56 
 
 
837 aa  710    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  47 
 
 
870 aa  816    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  47.82 
 
 
872 aa  771    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  40.84 
 
 
882 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 
873 aa  666    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.97 
 
 
872 aa  712    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  48.06 
 
 
872 aa  803    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 
904 aa  691    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  37.56 
 
 
871 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  44.68 
 
 
892 aa  762    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  45.65 
 
 
872 aa  776    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 
882 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
859 aa  684    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 
856 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  47.96 
 
 
863 aa  812    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
867 aa  1751    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 
882 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 
903 aa  694    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  47.72 
 
 
870 aa  792    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  41.64 
 
 
892 aa  688    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  55.67 
 
 
870 aa  955    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.47 
 
 
855 aa  664    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  46.35 
 
 
895 aa  795    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  49.02 
 
 
868 aa  862    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 
887 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.87 
 
 
858 aa  742    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 
884 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 
884 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 
855 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 
905 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
862 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  47.44 
 
 
887 aa  825    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  50.87 
 
 
869 aa  846    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.9 
 
 
882 aa  801    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 
854 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 
856 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 
872 aa  658    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.82 
 
 
882 aa  715    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
856 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 
862 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 
856 aa  681    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 
874 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 
859 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 
853 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 
856 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  50.33 
 
 
910 aa  864    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  50.65 
 
 
910 aa  872    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 
856 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 
901 aa  658    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 
861 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 
861 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.13 
 
 
863 aa  642    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 
861 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  47.09 
 
 
859 aa  795    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 
871 aa  650    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
878 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  44.5 
 
 
840 aa  703    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  43.96 
 
 
857 aa  720    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 
854 aa  709    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  42.61 
 
 
852 aa  711    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 
890 aa  759    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 
857 aa  761    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 
889 aa  743    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.84 
 
 
868 aa  731    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>