253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1557 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
111 aa  217  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  48.65 
 
 
113 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  45.05 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  44.95 
 
 
111 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  44.95 
 
 
111 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  46.73 
 
 
111 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 
114 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  41.35 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  94.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  43.3 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  44.76 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 
112 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  42 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  41.94 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  85.5  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.65 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  29.73 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.98 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.41 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  35.16 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.7 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.7 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.7 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.29 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.43 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.07 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  33.7 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  29.47 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  31.58 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
112 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.17 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  29.17 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  22.77 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  21.78 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
111 aa  57.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.01 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  28.72 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  23.91 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  29.73 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  24.3 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  21.65 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 
120 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  25.88 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  22.22 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  27.96 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  23.16 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 
113 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  21.65 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  19.8 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  30.88 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 
115 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  27.27 
 
 
111 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.79 
 
 
437 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 
111 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  32.98 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>