More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1463 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 
303 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  45.86 
 
 
289 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  41.04 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  45.89 
 
 
289 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 
296 aa  231  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  43.73 
 
 
286 aa  225  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  38.62 
 
 
291 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  38.85 
 
 
310 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  41.02 
 
 
292 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  36.3 
 
 
735 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  38.57 
 
 
280 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  39.56 
 
 
318 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  37.79 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  35.79 
 
 
759 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.66 
 
 
761 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  35.31 
 
 
305 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  35.08 
 
 
337 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  35.81 
 
 
414 aa  188  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35.08 
 
 
316 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  33.84 
 
 
327 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 
323 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 
323 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 
323 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 
323 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 
323 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  36 
 
 
989 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  35.53 
 
 
310 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
323 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  39.62 
 
 
316 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  36.4 
 
 
304 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  34.55 
 
 
311 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  33.11 
 
 
307 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  35.12 
 
 
417 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  37.06 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.42 
 
 
754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  30.62 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.05 
 
 
754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  36.78 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  35.4 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.49 
 
 
750 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  32.87 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.51 
 
 
754 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.07 
 
 
754 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.07 
 
 
754 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.36 
 
 
977 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.11 
 
 
755 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  33.88 
 
 
328 aa  171  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  33.89 
 
 
307 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  34.54 
 
 
309 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.14 
 
 
754 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.13 
 
 
304 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.72 
 
 
754 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.81 
 
 
759 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36.13 
 
 
304 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  36.19 
 
 
412 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.81 
 
 
759 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.07 
 
 
754 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  34.78 
 
 
301 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.07 
 
 
754 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  35.77 
 
 
313 aa  169  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.41 
 
 
763 aa  169  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  34.32 
 
 
306 aa  169  8e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  33.55 
 
 
321 aa  168  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  33.92 
 
 
322 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 
324 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  33.92 
 
 
322 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  34.09 
 
 
308 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  33.99 
 
 
302 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  33.92 
 
 
322 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.02 
 
 
752 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.09 
 
 
311 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.67 
 
 
750 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  35.95 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  35.61 
 
 
313 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  31.67 
 
 
357 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.1 
 
 
911 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  31.65 
 
 
347 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  32.99 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33.91 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.88 
 
 
740 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  34.34 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  32.54 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  34.64 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  36.27 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  34.49 
 
 
311 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 
313 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  31.27 
 
 
310 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 
313 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>