More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1369 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
454 aa  917    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 
447 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 
477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 
454 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 
454 aa  133  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.39 
 
 
483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 
447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 
468 aa  126  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 
449 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 
450 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 
449 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 
455 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  24.14 
 
 
448 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 
429 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  25.93 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 
339 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
459 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.28 
 
 
390 aa  94  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 
434 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 
443 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  25.3 
 
 
452 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  22.12 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  23.72 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 
510 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  23.14 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 
444 aa  79  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  21.76 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 
454 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.98 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.75 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  22.76 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  34.64 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  20.49 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.96 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.73 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.02 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  21.92 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  25.42 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  21.49 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  20.81 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  19.64 
 
 
499 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  20.59 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  22.73 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.36 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  21.43 
 
 
507 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 
453 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.9 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  22.47 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  20.51 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  21.91 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 
391 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  23.68 
 
 
391 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  23.68 
 
 
391 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 
397 aa  63.9  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 
385 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.24 
 
 
385 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 
385 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 
385 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 
385 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.24 
 
 
385 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  21.91 
 
 
408 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>