More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1313 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  100 
 
 
595 aa  1202  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  41.57 
 
 
600 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  47.56 
 
 
599 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  38.05 
 
 
604 aa  399  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  42.11 
 
 
596 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  47.14 
 
 
595 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  47.38 
 
 
595 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  37.29 
 
 
599 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  35.19 
 
 
617 aa  359  9e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  32.56 
 
 
601 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  41.04 
 
 
544 aa  352  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.06361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  42.54 
 
 
614 aa  346  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.45 
 
 
626 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  39.96 
 
 
601 aa  343  6e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.04 
 
 
605 aa  343  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.14 
 
 
598 aa  343  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  35.16 
 
 
611 aa  340  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  38.22 
 
 
593 aa  340  6e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.07 
 
 
604 aa  338  1e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.85 
 
 
599 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.23 
 
 
598 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.23 
 
 
598 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.23 
 
 
598 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.23 
 
 
598 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.94887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.23 
 
 
598 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.23 
 
 
571 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.23 
 
 
598 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  38.74 
 
 
600 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  38.98 
 
 
598 aa  330  5e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.25124e-06  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  38.98 
 
 
598 aa  330  5e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.36 
 
 
588 aa  328  1e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  39.59 
 
 
656 aa  328  2e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.57 
 
 
587 aa  327  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  40.05 
 
 
660 aa  326  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  35.77 
 
 
623 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  38.01 
 
 
662 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.01 
 
 
598 aa  323  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  40.09 
 
 
703 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  41.53 
 
 
640 aa  322  1e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  35.88 
 
 
640 aa  321  2e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  39.11 
 
 
583 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40.38 
 
 
619 aa  319  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  38.39 
 
 
653 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  41.41 
 
 
646 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  41.41 
 
 
646 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.12 
 
 
582 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  35.19 
 
 
571 aa  316  8e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  39.8 
 
 
633 aa  316  1e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  31.78 
 
 
587 aa  313  4e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  39.64 
 
 
674 aa  313  5e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  38.64 
 
 
657 aa  310  5e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  36.3 
 
 
590 aa  310  7e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  40.44 
 
 
632 aa  308  1e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  36.77 
 
 
590 aa  308  2e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  38.15 
 
 
704 aa  308  2e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.93 
 
 
694 aa  307  4e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.17 
 
 
614 aa  306  5e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  33.84 
 
 
582 aa  305  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.55759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  33.84 
 
 
582 aa  305  1e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.95537e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  33.84 
 
 
582 aa  305  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.22663e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  38.12 
 
 
686 aa  304  3e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  37.45 
 
 
632 aa  303  4e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  36.3 
 
 
588 aa  304  4e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  40.33 
 
 
675 aa  304  4e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  35.65 
 
 
585 aa  303  6e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.99 
 
 
636 aa  302  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  40.38 
 
 
636 aa  302  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  35.81 
 
 
673 aa  301  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  37.86 
 
 
642 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.35 
 
 
613 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  40.24 
 
 
578 aa  301  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  30.21 
 
 
605 aa  301  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  34.75 
 
 
684 aa  301  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  38.71 
 
 
613 aa  301  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  30.21 
 
 
605 aa  301  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  32.72 
 
 
582 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  37.67 
 
 
682 aa  300  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.61 
 
 
584 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  35.55 
 
 
575 aa  299  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.61 
 
 
656 aa  299  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  43.65 
 
 
577 aa  299  8e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  41.08 
 
 
574 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.53498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  37.53 
 
 
660 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  41.89 
 
 
601 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  39.59 
 
 
679 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  41.35 
 
 
574 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.82839e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  41.78 
 
 
584 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33.06 
 
 
601 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  41.08 
 
 
574 aa  297  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  41.08 
 
 
574 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  41.08 
 
 
574 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  35.68 
 
 
667 aa  296  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  41.08 
 
 
574 aa  297  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  38.22 
 
 
617 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  41.08 
 
 
574 aa  296  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  37.38 
 
 
641 aa  296  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  41.08 
 
 
574 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  46.2 
 
 
587 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  36.12 
 
 
598 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  37.38 
 
 
641 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>