More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1284 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  100 
 
 
443 aa  914    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  62.73 
 
 
447 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  64.9 
 
 
445 aa  584  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  62.84 
 
 
439 aa  575  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  56.98 
 
 
440 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  56.24 
 
 
441 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  57.51 
 
 
435 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  56.26 
 
 
435 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  56.65 
 
 
434 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  57.07 
 
 
485 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  56.55 
 
 
434 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  56.77 
 
 
457 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  55.84 
 
 
448 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  58.82 
 
 
423 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  55.58 
 
 
457 aa  483  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  55.34 
 
 
457 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  53.65 
 
 
505 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  54.61 
 
 
432 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  52.91 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  51.93 
 
 
459 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 
447 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  50.94 
 
 
450 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 
459 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 
446 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 
447 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 
441 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  51.98 
 
 
435 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  50 
 
 
455 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 
544 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
461 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  50.95 
 
 
453 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 
453 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 
451 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 
443 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 
441 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  51.4 
 
 
440 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 
441 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 
444 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  50 
 
 
441 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  53.1 
 
 
432 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  50.93 
 
 
440 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  51.19 
 
 
442 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 
458 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 
441 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 
447 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  51.19 
 
 
442 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  52.27 
 
 
437 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  48.7 
 
 
447 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 
458 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  51.2 
 
 
438 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  49.76 
 
 
447 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  49.76 
 
 
447 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
447 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 
443 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
447 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  51.82 
 
 
437 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
447 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  48.6 
 
 
463 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  48.82 
 
 
449 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  49.2 
 
 
451 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
447 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 
432 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
447 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  51.82 
 
 
437 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 
451 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
447 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  49.76 
 
 
447 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
441 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
447 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
447 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  50 
 
 
440 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 
430 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
447 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
441 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
447 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 
441 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  49.28 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  47.89 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  47.89 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.16 
 
 
731 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  48.42 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 
443 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  50.12 
 
 
440 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 
440 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 
446 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  46.95 
 
 
443 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 
437 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 
435 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  50.95 
 
 
427 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 
437 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  52.55 
 
 
444 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 
445 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  47.95 
 
 
453 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  46.95 
 
 
443 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 
443 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  48.03 
 
 
447 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  48.74 
 
 
444 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>