183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0986 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  49.82 
 
 
271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.85 
 
 
270 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.12 
 
 
278 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  36.36 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  34.91 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  28.33 
 
 
304 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.12 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  26.72 
 
 
303 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.6 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  26.3 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.3 
 
 
272 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5217  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.3 
 
 
272 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.592377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  29 
 
 
301 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  29.11 
 
 
298 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  29.11 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  28.69 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  24.63 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  28.69 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  32.12 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  26.14 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  26.52 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  29.8 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  32.12 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  26.04 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  29.58 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  26.53 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  29.2 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  29.27 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.02 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  27.43 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  23.62 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  29.02 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  31.55 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  29.93 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.65 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  27.78 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2490  xylose isomerase domain-containing protein  34.83 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00709656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  22.85 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  27.78 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  29.02 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.63 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  30.63 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  26.15 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  29.59 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.63 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  26.97 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  25.55 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  27.38 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.14 
 
 
924 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.8 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.12 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  25.1 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  22.58 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  25.7 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  26.97 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.36 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  24.72 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  24.72 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  24.72 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  24.72 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  24.72 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.4 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  26.42 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  32.91 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.58 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  23.42 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  24.87 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.16 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  31.65 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  24.35 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  24.35 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  26.39 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  30.18 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  28.73 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  27.27 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  26.11 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  30.36 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  23.18 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  29.59 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  30.18 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  30.18 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  24.32 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  28.99 
 
 
309 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  23.24 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  22.56 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  23.51 
 
 
300 aa  62.4  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  23.24 
 
 
350 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  30.38 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  23.51 
 
 
300 aa  62  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  21.11 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  22.35 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  23.24 
 
 
368 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  21.45 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.25 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  23.32 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.14 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  23.32 
 
 
296 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>