269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0958 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  259  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  40.26 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  40.26 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  38.96 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  38.96 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  38.96 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  38.96 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  38.96 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 199 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4546  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000650042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 199 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 199 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 199 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  39.71 
 
 		 219 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  42.42 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.57 
 
 		 481 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  30.14 
 
 		 235 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  44.62 
 
 		 233 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 504 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 490 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  44.62 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  44.62 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  37.1 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 359 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 211 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  27.21 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 198 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 495 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 490 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 201 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  34.67 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  34.85 
 
 		 240 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  34.85 
 
 		 240 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  37.29 
 
 		 367 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 367 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 300 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.37 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  30.17 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 260 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  34.29 
 
 		 347 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 227 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  29.89 
 
 		 488 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  30.69 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 227 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>