More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0954 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  854    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  40.65 
 
 
383 aa  192  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  37.15 
 
 
333 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  38.68 
 
 
370 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  27.34 
 
 
576 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  27.05 
 
 
323 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  28.79 
 
 
375 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.17 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  38.26 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  29.14 
 
 
440 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  28.47 
 
 
468 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.34 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.11 
 
 
803 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.56 
 
 
504 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.82 
 
 
508 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  25.08 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  23.81 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  27.83 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  26.81 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.24 
 
 
77 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.67 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  27.6 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0015  Beta-lactamase class A  27.43 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  23.53 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  24.89 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  24.51 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  24.51 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40.91 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.89 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  24.54 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  26.44 
 
 
305 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  44.32 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  25.09 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  25.74 
 
 
296 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  27.73 
 
 
291 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.48 
 
 
974 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  35.2 
 
 
438 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  25.11 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.48 
 
 
554 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  46.3 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0013  hypothetical protein  27.06 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  34.31 
 
 
234 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  23.39 
 
 
297 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.16 
 
 
334 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  35.79 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  24.11 
 
 
292 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  46.3 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  33.6 
 
 
239 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.59 
 
 
319 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  23.69 
 
 
315 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  23.74 
 
 
296 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  24.06 
 
 
289 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  22.39 
 
 
295 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  23.25 
 
 
356 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  42.59 
 
 
424 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  24.81 
 
 
286 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 
438 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  25.38 
 
 
300 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0795  hypothetical protein  27.5 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.845629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  23.9 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  27.17 
 
 
276 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  42.59 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  46.15 
 
 
762 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  36.59 
 
 
184 aa  59.3  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  42.59 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  27.21 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  27.71 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  24.55 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  37.93 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  33.66 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 
239 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.42 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  24.11 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  43.84 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  25 
 
 
315 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.88 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.88 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  47.76 
 
 
546 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  25.81 
 
 
338 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.88 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  26.26 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.48 
 
 
128 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  30.51 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  22.27 
 
 
297 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  41.51 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  43.06 
 
 
352 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.12 
 
 
274 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 
508 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  38.46 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
232 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 
266 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.62 
 
 
283 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19610  negative regulator of beta-lactamase expression  40.24 
 
 
248 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.88 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  23.57 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  30.43 
 
 
522 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  23.98 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>