More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0867 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 
210 aa  308  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  64.59 
 
 
209 aa  289  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  64.59 
 
 
209 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  67.77 
 
 
212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  69.08 
 
 
209 aa  284  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 
212 aa  280  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 
209 aa  279  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 
209 aa  275  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  61.24 
 
 
211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 
211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  64.29 
 
 
209 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  63.77 
 
 
211 aa  271  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 
209 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  64.85 
 
 
213 aa  259  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  61.72 
 
 
210 aa  258  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  62.5 
 
 
211 aa  258  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  62.98 
 
 
210 aa  257  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  62.98 
 
 
210 aa  257  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 
212 aa  249  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  58.65 
 
 
213 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  62.68 
 
 
208 aa  248  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  60.29 
 
 
208 aa  241  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  57.21 
 
 
207 aa  241  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  55.24 
 
 
210 aa  241  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  58.1 
 
 
210 aa  240  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  57.87 
 
 
220 aa  240  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 
213 aa  240  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  55.05 
 
 
217 aa  238  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 
210 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  56.48 
 
 
220 aa  236  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  56.94 
 
 
220 aa  236  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  55.29 
 
 
209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  55.5 
 
 
222 aa  234  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  58.13 
 
 
211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  57.35 
 
 
205 aa  231  5e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 
211 aa  231  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  55.39 
 
 
206 aa  231  7.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  53.37 
 
 
216 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 
212 aa  229  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  56.86 
 
 
207 aa  228  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  56.86 
 
 
207 aa  228  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  58.82 
 
 
212 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  58.82 
 
 
212 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 
210 aa  228  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  56.65 
 
 
213 aa  227  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 
210 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 
228 aa  226  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 
218 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 
211 aa  225  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 
210 aa  223  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 
211 aa  223  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 
211 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 
218 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 
218 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 
210 aa  222  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 
218 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
218 aa  221  7e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  56.37 
 
 
212 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  55.67 
 
 
211 aa  221  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 
219 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 
209 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 
223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  54.37 
 
 
215 aa  216  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  53.14 
 
 
213 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  52.29 
 
 
227 aa  217  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 
212 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  54.81 
 
 
247 aa  215  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  55.24 
 
 
207 aa  215  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  55.4 
 
 
214 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 
217 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  48.57 
 
 
210 aa  214  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  55.39 
 
 
209 aa  214  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 
217 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 
218 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  51.69 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  51.52 
 
 
209 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  54.59 
 
 
209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  51.46 
 
 
210 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  56.13 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
208 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 
217 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  56.6 
 
 
212 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  49.51 
 
 
206 aa  209  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  54.59 
 
 
209 aa  209  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 
216 aa  209  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
223 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>