More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0862 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
133 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 
135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 
124 aa  210  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 
126 aa  210  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 
126 aa  210  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  82.79 
 
 
134 aa  208  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
135 aa  207  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  83.06 
 
 
124 aa  206  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  81.45 
 
 
124 aa  204  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
128 aa  204  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  81.3 
 
 
123 aa  204  5e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
123 aa  202  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 
124 aa  201  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 
124 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  201  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  200  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  76.15 
 
 
139 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  79.67 
 
 
124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 
125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
124 aa  197  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 
124 aa  197  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  79.67 
 
 
124 aa  196  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  196  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 
124 aa  196  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 
124 aa  196  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  196  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 
124 aa  196  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 
127 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 
127 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  79.34 
 
 
122 aa  196  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  78.05 
 
 
124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  78.86 
 
 
124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  194  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  194  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
125 aa  194  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  79.03 
 
 
124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
145 aa  193  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 
124 aa  194  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
124 aa  193  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
124 aa  193  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  193  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  193  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 
124 aa  193  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  192  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  192  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  192  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
125 aa  192  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 
122 aa  192  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  192  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 
122 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
136 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
124 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  191  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
124 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
126 aa  191  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
124 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  76.23 
 
 
123 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  191  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  191  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
135 aa  191  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
125 aa  191  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 
123 aa  190  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 
123 aa  190  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
128 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 
123 aa  190  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  191  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
124 aa  191  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  191  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
137 aa  190  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
125 aa  190  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
125 aa  190  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
140 aa  190  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  190  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  190  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  82.93 
 
 
123 aa  190  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
128 aa  190  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
129 aa  190  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  190  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
125 aa  190  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  189  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  75.61 
 
 
142 aa  189  8e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
136 aa  189  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 
124 aa  189  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 
137 aa  189  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  73.72 
 
 
137 aa  189  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
140 aa  189  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>