46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0853 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 
51 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  52.38 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  54.76 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  45.24 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
60 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 
81 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  43.18 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  43.18 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  48.94 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  45.71 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  47.5 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  38.64 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  43.18 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  51.11 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  48.72 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  39.02 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  39.02 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  39.02 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.59 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  39.02 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  47.5 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  39.53 
 
 
59 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  40.43 
 
 
127 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  45 
 
 
62 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  43.9 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  43.9 
 
 
63 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
73 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  46.34 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  43.9 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  41.46 
 
 
63 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  37.21 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  47.37 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  38.3 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  41.03 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  44.74 
 
 
64 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>