More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0836 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 457 aa  926    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  54 
 
 		 454 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  54.53 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  54.82 
 
 		 457 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 453 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  54.37 
 
 		 457 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  51.65 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  54.33 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  54.67 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  50.89 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  52.01 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  50.89 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  50.88 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  54.33 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 452 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  48.21 
 
 		 460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.99 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  49 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  51 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  49 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  50.45 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  49.01 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  48.99 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 		 448 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  47.54 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  48.67 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.99 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  47.26 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  47.46 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  47.11 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  46.48 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  48.11 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  47.51 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  49.21 
 
 		 445 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  45.7 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  46.81 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  50.95 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  46.81 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  48.87 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  47.97 
 
 		 520 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  45.91 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  45.53 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  47.55 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  45.99 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  43.43 
 
 		 518 aa  425  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  47.48 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 		 517 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  44.99 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 457 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  47.47 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  44.96 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  45.68 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  45.17 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  45.09 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  45.76 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  45.21 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 		 462 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  49.87 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  44.49 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  45.3 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  45.21 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  46.05 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  44.78 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  44.22 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0406  DNA repair protein RadA  45.04 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  46.5 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>