More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0685 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
436 aa  855    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.74 
 
 
782 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
1261 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.74 
 
 
828 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  29.39 
 
 
1550 aa  95.5  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.33 
 
 
1238 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
412 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  27.14 
 
 
650 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.78 
 
 
2145 aa  88.6  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.06 
 
 
991 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  25.46 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  25.46 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
1060 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
1526 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.84 
 
 
985 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 
923 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  28.82 
 
 
671 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  26.32 
 
 
755 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
1101 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.71 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 
1180 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  28 
 
 
844 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
1313 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 
809 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  24.24 
 
 
1611 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
949 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.4 
 
 
1279 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.11 
 
 
1266 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
1063 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.12 
 
 
852 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.11 
 
 
957 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  26.56 
 
 
1147 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  19.74 
 
 
1360 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.29 
 
 
816 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 
758 aa  70.1  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
760 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  23.94 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
809 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3806  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
600 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0299153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
1285 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  21.65 
 
 
941 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
1025 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  20.75 
 
 
1429 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  22.49 
 
 
999 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  43.42 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  22.34 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
714 aa  64.3  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
833 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 
1195 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
481 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
1298 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.63 
 
 
560 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  24.88 
 
 
975 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.22 
 
 
868 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  28.4 
 
 
490 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  29.94 
 
 
695 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  19.44 
 
 
1295 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  22.94 
 
 
834 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  24.35 
 
 
971 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.05 
 
 
1404 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 
421 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25.94 
 
 
2327 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 
1015 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  19.2 
 
 
725 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
105 aa  60.1  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2664  putative PAS/PAC sensor protein  25.77 
 
 
695 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.228466  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  43.08 
 
 
403 aa  59.7  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  43.08 
 
 
403 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  43.08 
 
 
403 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  21.01 
 
 
1596 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  43.08 
 
 
403 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  43.08 
 
 
403 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
1054 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  43.06 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  43.08 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
1162 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  43.06 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 
1162 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  22.93 
 
 
1108 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  24.74 
 
 
965 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
1298 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
343 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  18.99 
 
 
941 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 
181 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.36 
 
 
1009 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  25.99 
 
 
992 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  23.28 
 
 
827 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
1215 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  21.98 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.78 
 
 
771 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.27 
 
 
689 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
791 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.12 
 
 
1422 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  22.38 
 
 
962 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
750 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  22.96 
 
 
364 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>