More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0600 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  58.69 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  56.81 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  51.33 
 
 		 226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  54.55 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  55.4 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  51.74 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  41.5 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  42.64 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  35.75 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 228 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  33.66 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 238 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 238 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 233 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  34.33 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  37.43 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 265 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>