More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0551 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  66.12 
 
 
263 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  64.08 
 
 
250 aa  335  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  62.65 
 
 
258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  64.68 
 
 
248 aa  322  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  60.82 
 
 
245 aa  321  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  64.96 
 
 
247 aa  317  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  63.37 
 
 
258 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  64.56 
 
 
240 aa  317  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  63.11 
 
 
256 aa  315  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  62.14 
 
 
245 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  62.14 
 
 
245 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  62.14 
 
 
245 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  62.14 
 
 
245 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  62.14 
 
 
245 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  60.91 
 
 
245 aa  315  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  62.98 
 
 
248 aa  314  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  61.73 
 
 
245 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  61.73 
 
 
245 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  61.73 
 
 
245 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  65.55 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  61.73 
 
 
245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  60.16 
 
 
244 aa  310  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  60 
 
 
246 aa  309  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  60.16 
 
 
255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  60.76 
 
 
238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  59.49 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  59.49 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  59.07 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  58.78 
 
 
261 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  59.49 
 
 
244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  62.13 
 
 
238 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  64.56 
 
 
238 aa  304  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  64.14 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  60.34 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  59.49 
 
 
239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  63.71 
 
 
238 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  63.71 
 
 
238 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  63.71 
 
 
238 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  59.57 
 
 
242 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  63.71 
 
 
238 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  59.57 
 
 
242 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  63.71 
 
 
238 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  58.62 
 
 
243 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  60.52 
 
 
238 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  62.03 
 
 
239 aa  300  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  63.29 
 
 
238 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  61.7 
 
 
238 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  63.29 
 
 
238 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  63.29 
 
 
238 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  63.29 
 
 
238 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  63.29 
 
 
238 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  63.29 
 
 
238 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  63.29 
 
 
238 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  59.05 
 
 
241 aa  298  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  60.34 
 
 
238 aa  298  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  61.09 
 
 
245 aa  298  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  60.17 
 
 
246 aa  298  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  62.87 
 
 
238 aa  298  9e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  297  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  59.26 
 
 
245 aa  297  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  57.63 
 
 
238 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  61.18 
 
 
239 aa  295  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  57.38 
 
 
246 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  60.76 
 
 
238 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  60.76 
 
 
238 aa  295  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  57.38 
 
 
246 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  57.38 
 
 
248 aa  295  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  58.58 
 
 
239 aa  295  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  59.07 
 
 
238 aa  293  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  56.72 
 
 
253 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  64.47 
 
 
230 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  58.16 
 
 
239 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  58.16 
 
 
239 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  59.15 
 
 
238 aa  292  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  59.15 
 
 
238 aa  292  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  57.32 
 
 
239 aa  291  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  56.12 
 
 
243 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  56.07 
 
 
241 aa  290  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  56.17 
 
 
238 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  57.02 
 
 
238 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  57.63 
 
 
239 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  59.57 
 
 
238 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  57.38 
 
 
238 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  57.38 
 
 
240 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  56.36 
 
 
238 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  59.49 
 
 
239 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  55.7 
 
 
246 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  55.7 
 
 
246 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  55.7 
 
 
246 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  59.48 
 
 
235 aa  288  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  59.48 
 
 
235 aa  288  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  56.17 
 
 
239 aa  288  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  56.54 
 
 
246 aa  288  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  59.92 
 
 
238 aa  288  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  57.02 
 
 
238 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  61.5 
 
 
239 aa  288  7e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  60.43 
 
 
231 aa  288  7e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  55.7 
 
 
246 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>