221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0341 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  95.94 
 
 
394 aa  764    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  100 
 
 
394 aa  788    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  44.47 
 
 
403 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  36.72 
 
 
405 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.29 
 
 
409 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  26.63 
 
 
395 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  27.82 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  25.38 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
387 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.65 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 
405 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  28.07 
 
 
394 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  27.82 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.06 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  27.84 
 
 
830 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  26.19 
 
 
379 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  26.19 
 
 
379 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  32.95 
 
 
408 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  26.35 
 
 
379 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  23.14 
 
 
775 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  26.35 
 
 
379 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  26.06 
 
 
379 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  27.69 
 
 
378 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  24.54 
 
 
396 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  27.93 
 
 
378 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  27.08 
 
 
379 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  27.08 
 
 
379 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  26.84 
 
 
379 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 
377 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  26.37 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  24.15 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  23.45 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  24.43 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  24.43 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  24.43 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  24.43 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  24.43 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  24.52 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  24.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  24.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  24.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  24.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  24.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  24.14 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  23.49 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  24.61 
 
 
405 aa  63.9  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  20.84 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  20.63 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 
368 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.26 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  25 
 
 
193 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  24.68 
 
 
157 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 
378 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  21.76 
 
 
368 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  21.76 
 
 
368 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  22.4 
 
 
429 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  24.16 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.65 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  22.25 
 
 
391 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 
366 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  27.59 
 
 
389 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
370 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>