251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0306 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  100 
 
 
250 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  39.76 
 
 
248 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  38.4 
 
 
250 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  35.08 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  35.08 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.58 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.68 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.68 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34.55 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34.55 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  34.55 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  34.55 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  34.55 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  34.55 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  34.55 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.62 
 
 
268 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.47 
 
 
248 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.88 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.91 
 
 
249 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 
251 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.83 
 
 
251 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.24 
 
 
251 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.23 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.35 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.33 
 
 
251 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.62 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.54 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.15 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.05 
 
 
249 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.62 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  28.86 
 
 
254 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.05 
 
 
254 aa  105  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.05 
 
 
254 aa  105  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.69 
 
 
268 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.4 
 
 
254 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.73 
 
 
260 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.64 
 
 
276 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  28.05 
 
 
259 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.08 
 
 
264 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.81 
 
 
272 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.2 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  27.62 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.32 
 
 
258 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.51 
 
 
255 aa  99  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  28.16 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  27.5 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  27.38 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.03 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.34 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  30 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  27.87 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  27.87 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  28.1 
 
 
258 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.62 
 
 
240 aa  95.1  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  31.47 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.39 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.89 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  28.16 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  31.62 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.58 
 
 
251 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.13 
 
 
258 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.89 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.19 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  27.64 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.69 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.97 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  23.75 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  25.83 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  29.22 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.63 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.06 
 
 
278 aa  89  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.77 
 
 
270 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  26.53 
 
 
256 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  26.53 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.3 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.18 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.21 
 
 
252 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.49 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.6 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.67 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  29.1 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.64 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  27.24 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  29.28 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.28 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.49 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.69 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  28.22 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.97 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  28.74 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  27.8 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.85 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  27.8 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>