More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0297 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  100 
 
 		 330 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  94.55 
 
 		 330 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  44.74 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  44.15 
 
 		 346 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  46.98 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  49.83 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  43.18 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  41.62 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.04 
 
 		 338 aa  248  9e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  43.62 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  44.51 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  41.07 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  40.49 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  40.74 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  45.55 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  43.01 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  46.83 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  46.83 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  45.88 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.66 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  43.43 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  41.37 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  44.37 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  40.06 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  44.88 
 
 		 367 aa  228  8e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  39.05 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  42.67 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  38.55 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  41.67 
 
 		 380 aa  225  9e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.25 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  39.88 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  44.14 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  38.86 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  43.15 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  40 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  42.41 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  43.91 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  39.81 
 
 		 370 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.54 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  42.96 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  35.53 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  42.68 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  39.27 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  40 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  38.92 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.89 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  39.59 
 
 		 357 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  38.96 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  38.34 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.1 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  39.94 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  38.52 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  35.65 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  38.34 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  36.36 
 
 		 355 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.4 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  38.2 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  39.05 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.87 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  36.84 
 
 		 375 aa  208  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  39.12 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  38.72 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  38.68 
 
 		 344 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  39.23 
 
 		 340 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  42.61 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  39.86 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  36.34 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.42 
 
 		 345 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.2 
 
 		 343 aa  205  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  39.78 
 
 		 337 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 		 354 aa  205  9e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  35.99 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  35.99 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  35.99 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  38.11 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  41.47 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  35.51 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  37.21 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  38.41 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  38.39 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  39.56 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  39.94 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  37.28 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  38.92 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  36.31 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  41.75 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  37.73 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  34.22 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  38.06 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  35.49 
 
 		 452 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.14 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.68 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.47 
 
 		 381 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  33.44 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  33.64 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  45.88 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  40.14 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>