More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0195 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  100 
 
 		 389 aa  783    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  42.48 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  46.28 
 
 		 378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  46.28 
 
 		 378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  45.38 
 
 		 374 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  43.73 
 
 		 393 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  44.31 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  44.38 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  38.58 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  45.61 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  45.51 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  42.89 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  47.73 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  47.73 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  46.31 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  43.31 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 412 aa  289  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  45.61 
 
 		 359 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  46.15 
 
 		 381 aa  285  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  46.99 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  44.16 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  46.15 
 
 		 363 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  46.61 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  45.77 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  40.9 
 
 		 410 aa  278  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  44.67 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  39.63 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  46.36 
 
 		 365 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  44.83 
 
 		 364 aa  276  6e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  44.38 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  44.31 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  40.6 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  42.66 
 
 		 363 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  45.53 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  43.82 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  44.41 
 
 		 354 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  39.85 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  43.22 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  40.42 
 
 		 408 aa  269  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 360 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  45.8 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  37.47 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  44.06 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  44.54 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  43.28 
 
 		 385 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  38.36 
 
 		 407 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  38.32 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  42 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  37.89 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  46.18 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  40.28 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  39.9 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  43.36 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 		 418 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  42.77 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  40.47 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 411 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  44.71 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  38.58 
 
 		 419 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  41.06 
 
 		 418 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  37.66 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  38.18 
 
 		 430 aa  262  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.34 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.11 
 
 		 409 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  42.46 
 
 		 367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  36.75 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  42.03 
 
 		 369 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  44.19 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  39.95 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.02 
 
 		 415 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  44.25 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  37.01 
 
 		 417 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  37.01 
 
 		 449 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  43.06 
 
 		 371 aa  255  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  39.14 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  45.53 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  38.99 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  41.27 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  37.02 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  42.46 
 
 		 373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 		 420 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  40.68 
 
 		 357 aa  252  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  43.15 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  41.88 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  37.44 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  40.75 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  36.27 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  43.48 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  37.7 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  34.94 
 
 		 445 aa  248  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  37.08 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  38.72 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  36.24 
 
 		 453 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>