More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0130 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  100 
 
 
398 aa  776    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  32.1 
 
 
388 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  32.39 
 
 
391 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  27.27 
 
 
415 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  27.15 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  29.7 
 
 
406 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  27.15 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
406 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  27.27 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  23.18 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  27.75 
 
 
406 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25.98 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  27.47 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  27.47 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  24.82 
 
 
425 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  26.09 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  22.48 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  23.1 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  23.97 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  20.57 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  21.46 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05742  l-fucose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06730)  26.14 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.227595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  25.69 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  22.57 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  21.08 
 
 
507 aa  66.6  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  21.37 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  25.62 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  27 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.7 
 
 
505 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.72 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.03 
 
 
529 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  21.66 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  23.92 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
432 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  26.48 
 
 
417 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  20.96 
 
 
435 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  23.81 
 
 
433 aa  59.7  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  19.89 
 
 
421 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  24.11 
 
 
432 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  24.56 
 
 
391 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  20.88 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  23.72 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  21.49 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  21.49 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  22.69 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  21.49 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  21.49 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.27 
 
 
386 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  21.49 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  27.73 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  19.93 
 
 
421 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  23.72 
 
 
447 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  24.24 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  22.79 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  19.28 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.15 
 
 
424 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 
420 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  23.72 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  22.48 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  26.4 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  26.4 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.4 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  26.4 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  26.4 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  26.4 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  26.4 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  24.09 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.45 
 
 
405 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  25.95 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  23.72 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  22.85 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  26.4 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  22.16 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  29.73 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  20.77 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.03 
 
 
458 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  26.4 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  22.87 
 
 
428 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.03 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.03 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  25.22 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  22.16 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  22.16 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.9 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  22.16 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.18 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  21.33 
 
 
419 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  22.16 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  21.95 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  23.01 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>