276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0087 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0087  response regulator receiver protein  100 
 
 
116 aa  234  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000301897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1678  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.62 
 
 
481 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  29.41 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0706  response regulator receiver protein  31.73 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.381505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  33.93 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1273  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.57 
 
 
461 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321993  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2412  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2891  response regulator receiver protein  28.18 
 
 
135 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3288  response regulator receiver protein  26.47 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2408  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.5 
 
 
482 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1810  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.5 
 
 
482 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2034  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  26.89 
 
 
487 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.669583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  33.04 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3217  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.36 
 
 
501 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  30.25 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0031  helix-turn-helix, Fis-type  31.4 
 
 
421 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5134  response regulator receiver protein  31.09 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.06 
 
 
454 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1973  response regulator receiver protein  30.39 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00115006  hitchhiker  0.0000141072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1253  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  26.05 
 
 
484 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000517304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3857  response regulator receiver protein  29.41 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.43 
 
 
476 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5493  sporulation initiation phosphotransferase F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000162821  unclonable  2.17721e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  24.27 
 
 
470 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  29.91 
 
 
125 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  24.79 
 
 
455 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5429  sporulation initiation phosphotransferase F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.26925e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5466  stage 0 sporulation protein F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0750811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5185  stage 0 sporulation protein F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0413406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5020  stage 0 sporulation protein F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000180816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5036  stage 0 sporulation protein F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000486089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5514  sporulation initiation phosphotransferase F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000170867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.7 
 
 
456 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5581  stage 0 sporulation protein F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  32.71 
 
 
119 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5459  sporulation initiation phosphotransferase F  30.25 
 
 
122 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000856307  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2938  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  25.21 
 
 
488 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.337195  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0988  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.64 
 
 
468 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1616  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.48 
 
 
453 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2541  nitrogen regulation protein NR(I)  24.32 
 
 
470 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.85 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.67 
 
 
508 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  32.71 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0734  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  26.36 
 
 
477 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1510  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.963665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3047  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  25.21 
 
 
490 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4000  two component Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
240 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000203773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2820  nitrogen regulation protein NR(I)  25.21 
 
 
490 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122991  normal  0.465253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2072  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  23.53 
 
 
490 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1075  nitrogen regulation protein NR(I)  23.53 
 
 
491 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00433068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3340  response regulator receiver  26.89 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_004310  BR1117  nitrogen regulation protein NtrC  23.53 
 
 
491 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.837071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1058  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  24.8 
 
 
462 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0191246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.85 
 
 
220 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  23.81 
 
 
225 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.42 
 
 
486 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2116  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291778  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2154  response regulator receiver  29.73 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0828561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0247  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  27.59 
 
 
485 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898521  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.45 
 
 
243 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3651  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  28.1 
 
 
474 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.071917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  27.52 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4098  nitrogen regulation protein NR(I)  31.07 
 
 
470 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3758  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  24.8 
 
 
476 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1445  helix-turn-helix, Fis-type / nitrogen regulation protein NR(I)  24.79 
 
 
479 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal  0.9465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  21.77 
 
 
237 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  30.56 
 
 
467 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2059  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  23.14 
 
 
528 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0914415  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3740  response regulator receiver protein  29.17 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2336  two component transcriptional regulator  26.73 
 
 
244 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2137  two component response regulator  28.35 
 
 
454 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3939  putative two-component response regulatory protein, response regulator receiver  28.4 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.497488  normal  0.598376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  28.45 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.92 
 
 
455 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.090562  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3262  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  27.18 
 
 
471 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1837  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  23.97 
 
 
480 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  29.13 
 
 
469 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  29.13 
 
 
469 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 
472 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 
469 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 
469 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2074  two component Fis family transcriptional regulator  29.41 
 
 
227 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  26.61 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 
469 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 
472 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 
469 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  29.13 
 
 
469 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  29.13 
 
 
470 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0275  putative two component response regulator transcription regulator protein  31.58 
 
 
229 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.625871  normal  0.0173821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  23.46 
 
 
225 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  23.81 
 
 
225 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1577  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.67 
 
 
458 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0485  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  23.08 
 
 
482 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0514361  normal  0.01861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2147  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 
235 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313005  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3127  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.62 
 
 
464 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.816597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2269  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  23.39 
 
 
456 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2500  two component Fis family transcriptional regulator  26.72 
 
 
476 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2879  response regulator receiver protein  28.81 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000248411  hitchhiker  0.000371681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0246  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  23.58 
 
 
469 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.487777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>