More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0009 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  59.93 
 
 		 804 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  59.93 
 
 		 804 aa  668    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  55.75 
 
 		 804 aa  683    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  60.28 
 
 		 642 aa  772    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  65.41 
 
 		 795 aa  735    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  57.72 
 
 		 806 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  59.09 
 
 		 654 aa  743    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  60.09 
 
 		 638 aa  747    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  56.6 
 
 		 666 aa  701    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  66.03 
 
 		 643 aa  817    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  59.75 
 
 		 804 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  67.03 
 
 		 640 aa  830    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  58.96 
 
 		 654 aa  749    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  59.97 
 
 		 645 aa  725    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  58.45 
 
 		 769 aa  663    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  62.66 
 
 		 650 aa  769    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  53.94 
 
 		 653 aa  672    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  56.82 
 
 		 805 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  57.92 
 
 		 805 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  66.88 
 
 		 640 aa  829    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  58.96 
 
 		 654 aa  749    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  66.88 
 
 		 640 aa  829    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  58.96 
 
 		 654 aa  749    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  54.66 
 
 		 635 aa  702    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  66.25 
 
 		 640 aa  822    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  58.96 
 
 		 654 aa  749    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  57.31 
 
 		 805 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  57.49 
 
 		 805 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  57.92 
 
 		 805 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  60.81 
 
 		 661 aa  734    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  57.83 
 
 		 655 aa  740    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  65.83 
 
 		 633 aa  842    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  59.35 
 
 		 645 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  56.8 
 
 		 807 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  57.39 
 
 		 805 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  63.1 
 
 		 795 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  58.93 
 
 		 644 aa  753    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  59.59 
 
 		 655 aa  749    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  58.68 
 
 		 637 aa  764    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  60.53 
 
 		 655 aa  761    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  64.17 
 
 		 795 aa  730    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  59.31 
 
 		 797 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  56.7 
 
 		 813 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  66.88 
 
 		 640 aa  829    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  58.96 
 
 		 654 aa  749    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  58.86 
 
 		 769 aa  642    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  58.7 
 
 		 655 aa  737    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  60.22 
 
 		 645 aa  727    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  53.79 
 
 		 634 aa  689    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  66.99 
 
 		 634 aa  861    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  60.22 
 
 		 795 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  57.92 
 
 		 679 aa  692    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  57.42 
 
 		 675 aa  761    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  58.61 
 
 		 808 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  59.74 
 
 		 805 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  66.61 
 
 		 632 aa  870    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  59.82 
 
 		 805 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  59.76 
 
 		 879 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0546  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.74 
 
 		 711 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  56.07 
 
 		 675 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  61.49 
 
 		 644 aa  808    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  59.58 
 
 		 806 aa  673    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  58.59 
 
 		 655 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  57.32 
 
 		 652 aa  759    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  70.19 
 
 		 638 aa  877    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2326  DNA topoisomerase IV subunit B  49.54 
 
 		 648 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  70.35 
 
 		 638 aa  878    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2040  DNA topoisomerase IV subunit B  49.54 
 
 		 648 aa  651    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  60.58 
 
 		 807 aa  668    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  56.99 
 
 		 805 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  56.99 
 
 		 805 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  55.97 
 
 		 805 aa  681    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  58.64 
 
 		 805 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.66 
 
 		 633 aa  854    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  57.29 
 
 		 806 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  63.11 
 
 		 651 aa  771    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  55.7 
 
 		 644 aa  699    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  58.13 
 
 		 652 aa  734    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  55.06 
 
 		 674 aa  644    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  58.68 
 
 		 655 aa  702    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  54.2 
 
 		 661 aa  672    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  58.28 
 
 		 672 aa  707    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  58.75 
 
 		 655 aa  736    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  54.19 
 
 		 649 aa  681    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  62.87 
 
 		 650 aa  771    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  56.2 
 
 		 696 aa  734    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  67.62 
 
 		 628 aa  900    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  64 
 
 		 808 aa  706    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  57.81 
 
 		 812 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  56.99 
 
 		 805 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  57.32 
 
 		 666 aa  720    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  64.26 
 
 		 802 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  59.56 
 
 		 643 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  54.33 
 
 		 711 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  57.89 
 
 		 805 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  56.07 
 
 		 675 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  57.54 
 
 		 809 aa  647    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  55.62 
 
 		 675 aa  729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  60.94 
 
 		 798 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  58.63 
 
 		 769 aa  665    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>