194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0030 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0031  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.271657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0032  tRNA-Gly  98.15 
 
 		 71 bp  99.6  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.598279  normal  0.0388525 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0014  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000379014  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0015  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.685184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0035  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0011  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000624107  normal  0.164759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309072  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309123  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.658382  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309148  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0056  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0026  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.768519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0047  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5666  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000047392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0660742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0053  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000226275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0126  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5802  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00821355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5674  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5042  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0053  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000840189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>