More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5077 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 
461 aa  915  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  67.97 
 
 
470 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  69.76 
 
 
474 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  67.32 
 
 
464 aa  608  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  64.16 
 
 
470 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  64.16 
 
 
470 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  64.74 
 
 
471 aa  582  1e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  66.44 
 
 
464 aa  578  1e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  49.59 
 
 
495 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  47.11 
 
 
493 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  48.03 
 
 
489 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  48.15 
 
 
495 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  46.11 
 
 
487 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  46.9 
 
 
496 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  47.31 
 
 
496 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  45.79 
 
 
489 aa  407  1e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  46.93 
 
 
489 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  44.31 
 
 
486 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  39.77 
 
 
416 aa  313  3e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  40.99 
 
 
461 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  42.82 
 
 
413 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.93049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  40.95 
 
 
735 aa  304  2e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  37.89 
 
 
515 aa  292  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  41.87 
 
 
533 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  40.94 
 
 
533 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 
533 aa  289  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  41.16 
 
 
534 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  40.39 
 
 
532 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  38.6 
 
 
403 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.90493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.35 
 
 
535 aa  283  3e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  41.16 
 
 
533 aa  283  3e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  38.88 
 
 
474 aa  283  4e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  38.25 
 
 
411 aa  282  7e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  39.21 
 
 
410 aa  282  9e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  38.39 
 
 
468 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  43.75 
 
 
533 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  36.67 
 
 
399 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  42.15 
 
 
533 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.44 
 
 
533 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  40.46 
 
 
532 aa  276  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.57 
 
 
856 aa  276  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.16 
 
 
849 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.42 
 
 
848 aa  275  2e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.35 
 
 
530 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.64 
 
 
839 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.12 
 
 
525 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.76 
 
 
533 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  38.19 
 
 
415 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.18015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 
532 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.75 
 
 
761 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.66 
 
 
406 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  45.75 
 
 
524 aa  270  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  39.61 
 
 
594 aa  269  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  39.61 
 
 
594 aa  269  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  38.98 
 
 
403 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  39.66 
 
 
531 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  38.69 
 
 
530 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  39.34 
 
 
462 aa  266  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  5.22922e-05  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.27 
 
 
532 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.56 
 
 
853 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  38.31 
 
 
530 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  36.26 
 
 
473 aa  261  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.21 
 
 
535 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  38.65 
 
 
538 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.44 
 
 
533 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  40.9 
 
 
748 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  37.03 
 
 
449 aa  260  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  37.59 
 
 
554 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  35.92 
 
 
449 aa  259  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.19854e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  36.82 
 
 
449 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  4.78055e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 
534 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.46 
 
 
756 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  37.82 
 
 
531 aa  257  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.26 
 
 
512 aa  256  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  40.67 
 
 
411 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.72302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  41.62 
 
 
533 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  41.45 
 
 
457 aa  256  6e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 
532 aa  255  9e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.99 
 
 
554 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  36.99 
 
 
554 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  37.35 
 
 
843 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.26 
 
 
554 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.03 
 
 
856 aa  253  4e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  39.14 
 
 
535 aa  252  8e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  37.71 
 
 
556 aa  252  8e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  35.92 
 
 
472 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.66 
 
 
834 aa  252  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  37.56 
 
 
533 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  37.93 
 
 
526 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  37.09 
 
 
534 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  37.15 
 
 
534 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 
537 aa  249  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.78 
 
 
911 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  32.66 
 
 
885 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  39.9 
 
 
759 aa  247  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  1.07208e-07 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 
535 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  35.24 
 
 
554 aa  246  5e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.98 
 
 
554 aa  246  5e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.49 
 
 
845 aa  246  7e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  37.23 
 
 
533 aa  245  1e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>