More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4979 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
578 aa  1144    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  38.46 
 
 
1523 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  43.99 
 
 
1236 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  38.54 
 
 
1454 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.33 
 
 
1652 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.87 
 
 
677 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  38.46 
 
 
696 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  42.44 
 
 
1364 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  37.74 
 
 
1163 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.77 
 
 
676 aa  217  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.33 
 
 
682 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.13 
 
 
1686 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  40.51 
 
 
1363 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  39.34 
 
 
1221 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.57 
 
 
1760 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  40.71 
 
 
687 aa  205  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.26 
 
 
576 aa  203  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  34.57 
 
 
947 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  34.86 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.27 
 
 
1240 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  32.23 
 
 
1193 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  40.47 
 
 
778 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  39.11 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  39.02 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  33.82 
 
 
1213 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.31 
 
 
1557 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.82 
 
 
1789 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  34.06 
 
 
1868 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  39.48 
 
 
434 aa  194  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.63 
 
 
930 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  36.59 
 
 
1247 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  35.93 
 
 
1878 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  34.81 
 
 
1416 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.04 
 
 
596 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.44 
 
 
740 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.67 
 
 
664 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  33.58 
 
 
742 aa  187  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  35.61 
 
 
1188 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  37.13 
 
 
657 aa  186  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.05 
 
 
692 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 
1443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  38.91 
 
 
443 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  33.21 
 
 
1196 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 
1190 aa  183  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.14 
 
 
1357 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.58 
 
 
1711 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 
1474 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.58 
 
 
630 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  37.65 
 
 
577 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  37.24 
 
 
774 aa  182  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  37.92 
 
 
346 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  38.38 
 
 
1661 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  34.72 
 
 
344 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.93 
 
 
1188 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  32.14 
 
 
335 aa  178  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  34.28 
 
 
728 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  33.95 
 
 
316 aa  177  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.37 
 
 
1831 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  36.23 
 
 
334 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  34.29 
 
 
1211 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  34.56 
 
 
317 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  37.91 
 
 
344 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  37.55 
 
 
1714 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.21 
 
 
1481 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  39.15 
 
 
1599 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.27 
 
 
733 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  32.56 
 
 
1208 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  31.25 
 
 
316 aa  169  9e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  36.53 
 
 
1656 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.47 
 
 
1510 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.46 
 
 
1262 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.88 
 
 
1242 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  33.69 
 
 
1411 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.67 
 
 
608 aa  167  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  32.84 
 
 
1553 aa  167  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  33.12 
 
 
597 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1423  WD-40 repeat-containing protein  42.44 
 
 
239 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.36 
 
 
792 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.82 
 
 
642 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  36.2 
 
 
1858 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.51 
 
 
1176 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  31 
 
 
316 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.8 
 
 
1161 aa  163  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.96 
 
 
698 aa  163  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.35 
 
 
1552 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  39.81 
 
 
790 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.71 
 
 
919 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.71 
 
 
1039 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.8 
 
 
1161 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  30.21 
 
 
1177 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.1 
 
 
1214 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.97 
 
 
1280 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  31.89 
 
 
589 aa  160  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  31.37 
 
 
316 aa  160  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  30.31 
 
 
608 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  32.1 
 
 
335 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  30.91 
 
 
826 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  32.47 
 
 
1367 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 
1267 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  34.95 
 
 
652 aa  156  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>