More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4976 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  73.33 
 
 		 512 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  69.09 
 
 		 512 aa  739    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  67.52 
 
 		 512 aa  715    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 515 aa  1061    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  51.49 
 
 		 554 aa  534  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  45.51 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  45.49 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  49.28 
 
 		 511 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  49.51 
 
 		 516 aa  465  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  50.1 
 
 		 510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  46.52 
 
 		 645 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 		 502 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  45 
 
 		 595 aa  438  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  41.75 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  44.57 
 
 		 598 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  42.16 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  41.36 
 
 		 509 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  40.97 
 
 		 509 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  45.98 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  45.06 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  45.06 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  44.98 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  42.13 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  40.33 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  38.09 
 
 		 635 aa  310  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  38.34 
 
 		 504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  35.9 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  35.7 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  35.02 
 
 		 506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 506 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  34.83 
 
 		 516 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  32.95 
 
 		 520 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  33.66 
 
 		 507 aa  259  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  32.75 
 
 		 520 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  34.16 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  33.97 
 
 		 520 aa  253  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  32.87 
 
 		 503 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  33.98 
 
 		 504 aa  249  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  32.61 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  32.15 
 
 		 514 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 503 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  32.15 
 
 		 514 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  32.54 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  34.17 
 
 		 518 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  31.82 
 
 		 503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  33.78 
 
 		 518 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  31.29 
 
 		 522 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  31.63 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  31.03 
 
 		 505 aa  223  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  27.13 
 
 		 938 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 501 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.33 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 717 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  28.44 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 564 aa  117  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  25.68 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 722 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  28.38 
 
 		 708 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.39 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 565 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  25.76 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  28.21 
 
 		 711 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 556 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  26.08 
 
 		 499 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 547 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 554 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  25.49 
 
 		 504 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.71 
 
 		 492 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 547 aa  103  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  25.93 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 534 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  26.87 
 
 		 510 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  27.64 
 
 		 501 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 520 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.27 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 554 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 561 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25.27 
 
 		 518 aa  97.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.08 
 
 		 498 aa  97.1  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.12 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 559 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.43 
 
 		 511 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  24.63 
 
 		 512 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.53 
 
 		 533 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 520 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 520 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.51 
 
 		 740 aa  94  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 531 aa  93.6  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 500 aa  93.6  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  23.39 
 
 		 519 aa  93.2  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  23.51 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  24.34 
 
 		 535 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 536 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  25.34 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>