More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4945 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
750 aa  1555    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  44.26 
 
 
1154 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  33.46 
 
 
719 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
739 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  31.65 
 
 
740 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
739 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
738 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  35.76 
 
 
745 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  33.91 
 
 
747 aa  243  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.85 
 
 
816 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  35.15 
 
 
731 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  34.69 
 
 
731 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
739 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
3560 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 
3035 aa  200  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
718 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 
968 aa  198  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
754 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
706 aa  193  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
754 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
789 aa  190  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.63 
 
 
810 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  43.46 
 
 
878 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
808 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
828 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
828 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
4489 aa  180  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
1085 aa  179  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
833 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
828 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
833 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
700 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
824 aa  168  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.36 
 
 
632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
750 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.95 
 
 
708 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  24.32 
 
 
1014 aa  157  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 
685 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  35.94 
 
 
865 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 
732 aa  154  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.39 
 
 
725 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 
761 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  22.09 
 
 
699 aa  152  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.13 
 
 
1106 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
681 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  38.25 
 
 
764 aa  150  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
1486 aa  148  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
627 aa  148  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 
734 aa  145  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 
637 aa  144  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
750 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 
362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.19 
 
 
742 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  23.86 
 
 
781 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
647 aa  139  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
1714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
611 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
909 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  39.33 
 
 
622 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 
660 aa  135  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
713 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  35.75 
 
 
681 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  23.28 
 
 
680 aa  135  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.16 
 
 
837 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 
740 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 
790 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  24.02 
 
 
790 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.19 
 
 
875 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  22.96 
 
 
937 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
3145 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
649 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 
654 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
3172 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  45.93 
 
 
204 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  34.72 
 
 
887 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  26.33 
 
 
585 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 
647 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  24.21 
 
 
1415 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
3301 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  33.61 
 
 
603 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  23.87 
 
 
715 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 
974 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.26 
 
 
1676 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
1737 aa  128  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.07 
 
 
739 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  31.09 
 
 
832 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 
1252 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  23.71 
 
 
1221 aa  127  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 
1252 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 
667 aa  126  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
573 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
1106 aa  125  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
289 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
590 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 
818 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
289 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 
619 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  22.05 
 
 
590 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>