More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4806 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
876 aa  703  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  1.32365e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
874 aa  759  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
874 aa  730  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
897 aa  657  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
876 aa  714  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.29274e-05  hitchhiker  2.729e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
863 aa  717  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
876 aa  711  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
875 aa  662  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
880 aa  691  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
883 aa  647  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
897 aa  667  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
877 aa  747  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
880 aa  712  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
875 aa  661  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0723e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
865 aa  699  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  8.18492e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
884 aa  660  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
875 aa  650  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79189e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
876 aa  703  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  3.67228e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
882 aa  694  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
886 aa  648  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
876 aa  720  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
876 aa  709  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
878 aa  708  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
882 aa  700  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
888 aa  693  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
874 aa  747  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
876 aa  714  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
874 aa  747  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
884 aa  657  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
874 aa  762  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1437  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
874 aa  670  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.738644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
874 aa  746  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
876 aa  687  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
874 aa  702  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 
904 aa  647  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
880 aa  722  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
874 aa  729  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
874 aa  706  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
872 aa  698  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  4.64441e-06 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
876 aa  676  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
859 aa  690  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
903 aa  704  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  1.35737e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
931 aa  696  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
884 aa  636  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.06893e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
897 aa  666  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
876 aa  676  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
863 aa  711  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
896 aa  649  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
875 aa  660  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.22674e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
867 aa  663  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
879 aa  697  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
874 aa  733  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00511  alanyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
890 aa  1026  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.409533  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
889 aa  676  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
876 aa  707  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
875 aa  726  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
892 aa  712  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
874 aa  734  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
876 aa  714  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
876 aa  714  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
865 aa  690  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
905 aa  687  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  6.4855e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
865 aa  701  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
913 aa  642  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
876 aa  708  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
876 aa  702  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  68.91 
 
 
880 aa  1243  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
878 aa  764  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  46.16 
 
 
879 aa  728  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
878 aa  645  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
881 aa  679  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
879 aa  663  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
870 aa  649  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  72.83 
 
 
879 aa  1274  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
889 aa  637  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
875 aa  681  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
875 aa  683  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
875 aa  686  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  44.28 
 
 
876 aa  711  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0998  alanyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
875 aa  681  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.932608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
893 aa  694  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
880 aa  692  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
874 aa  675  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0223  alanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
894 aa  663  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0181746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
888 aa  641  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2952  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
883 aa  645  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
869 aa  721  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_50  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
876 aa  651  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000334801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
879 aa  681  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
882 aa  691  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
870 aa  702  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
865 aa  675  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
860 aa  697  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
890 aa  715  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
872 aa  705  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
875 aa  677  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
878 aa  725  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
877 aa  703  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
874 aa  647  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
874 aa  702  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>