More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4802 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  100 
 
 		 485 aa  997    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  56.73 
 
 		 460 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  57.64 
 
 		 455 aa  578  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  55.3 
 
 		 460 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  55.58 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  52.89 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  52.89 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  50.31 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  38.3 
 
 		 460 aa  339  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  37.01 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  37.16 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  35.49 
 
 		 458 aa  320  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  35.07 
 
 		 458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  35.07 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  35.07 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  35.07 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  34.86 
 
 		 454 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  34.66 
 
 		 458 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  34.86 
 
 		 454 aa  312  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  36.38 
 
 		 465 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  34.29 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  38.14 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  34.86 
 
 		 458 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  34.86 
 
 		 458 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  35.56 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.34 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  33.97 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  33.97 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  35.88 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  36.36 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  35.22 
 
 		 454 aa  299  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  35.44 
 
 		 459 aa  299  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  35.91 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  32.84 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  35.42 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  35.97 
 
 		 458 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  34.79 
 
 		 459 aa  282  9e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  34.79 
 
 		 459 aa  282  9e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.79 
 
 		 459 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.79 
 
 		 459 aa  282  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  35.1 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  34.79 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  35.18 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 459 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 459 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.54 
 
 		 455 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  32.64 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  32.99 
 
 		 448 aa  273  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.68 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  35.05 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  33.96 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  33.75 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  33.76 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  34.23 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  31.52 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  32.79 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  33.27 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  32.85 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.32 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  32.26 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  31.73 
 
 		 489 aa  250  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  31.37 
 
 		 459 aa  249  6e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  32.26 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  30.35 
 
 		 471 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  32.38 
 
 		 470 aa  249  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.15 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  30.15 
 
 		 451 aa  243  6e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.16 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.08 
 
 		 477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  30.21 
 
 		 457 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  29.96 
 
 		 479 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.43 
 
 		 488 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  32.16 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  29.38 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  29.72 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  32.35 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  30.57 
 
 		 481 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  30.32 
 
 		 397 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  30.24 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  30.74 
 
 		 468 aa  233  6e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  29.29 
 
 		 451 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  30.45 
 
 		 457 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  28.06 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  29.7 
 
 		 465 aa  230  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  30.61 
 
 		 470 aa  230  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  29.07 
 
 		 451 aa  229  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  30.43 
 
 		 471 aa  229  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  27.86 
 
 		 476 aa  229  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.58 
 
 		 513 aa  229  9e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  29.8 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  29.13 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  30.56 
 
 		 572 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.13 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  30.2 
 
 		 476 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.8 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  31.22 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  31.96 
 
 		 554 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.04 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>