65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4676 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  746    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  52.1 
 
 
367 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  46.28 
 
 
391 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  48.41 
 
 
394 aa  326  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  46.97 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  41.55 
 
 
366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  42.25 
 
 
353 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  34.62 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  31.25 
 
 
374 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  33.47 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  31.37 
 
 
386 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  28.78 
 
 
371 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  30.93 
 
 
345 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  27.2 
 
 
399 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  32.45 
 
 
378 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  33.22 
 
 
399 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  29.91 
 
 
370 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  29.91 
 
 
370 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  29.74 
 
 
341 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  27.95 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  32.12 
 
 
375 aa  99.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  32.49 
 
 
368 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  30.63 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  29.57 
 
 
470 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  30.04 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  33.03 
 
 
539 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  32.74 
 
 
389 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  35.03 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  26.61 
 
 
422 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  30.9 
 
 
370 aa  92.8  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  30.35 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  29.11 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  29.21 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  30.5 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  27.5 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  27.5 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  33.51 
 
 
638 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  28.52 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  25.14 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  27.4 
 
 
650 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  30.91 
 
 
617 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  30.25 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  25.87 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  33.09 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  30 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  35.45 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  32.73 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  22.56 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  23.93 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  30.52 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  28.1 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  24.83 
 
 
402 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  26.32 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  22.48 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  28.87 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  26.95 
 
 
320 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  24.12 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  26.36 
 
 
168 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  34.31 
 
 
135 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  25.84 
 
 
178 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  26.01 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  26.88 
 
 
589 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0465  hypothetical protein  22.13 
 
 
181 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.559126  normal  0.33995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  27.55 
 
 
221 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  27.55 
 
 
221 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>