More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4672 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4672  twitching motility protein  100 
 
 		 429 aa  878    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  67.05 
 
 		 431 aa  501  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0015  twitching motility protein  65.25 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  63.66 
 
 		 428 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  63.1 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  63.1 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2349  twitching motility protein  57.14 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  60.57 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06741  PilT2-like protein  52.36 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0637  twitching motility protein  52.69 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1724  pilus retraction protein PilT  58.01 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  43.66 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  43.27 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  42.57 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  42.35 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  43.27 
 
 		 344 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  42.35 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  42.65 
 
 		 345 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  42.35 
 
 		 344 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  42.35 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  42.35 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  42.35 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  42.06 
 
 		 345 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  43.07 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  42.06 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  42.06 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  42.06 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  42.06 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  43.07 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  41.52 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  44.07 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  44.07 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  44.07 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  41.47 
 
 		 345 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  43.03 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  41.47 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  41.76 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  43.11 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  43.11 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  41.79 
 
 		 347 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  43.16 
 
 		 347 aa  273  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  42.65 
 
 		 344 aa  272  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  41.52 
 
 		 344 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  42.94 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  42.86 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  42.59 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  41.81 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  42.18 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  42.35 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  42.25 
 
 		 347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  44.07 
 
 		 347 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  41.59 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  41.52 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  42.86 
 
 		 347 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  42.86 
 
 		 347 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  42.07 
 
 		 349 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  42.35 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  42.86 
 
 		 345 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  41.83 
 
 		 356 aa  266  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  42.38 
 
 		 347 aa  266  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  43.16 
 
 		 347 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  43.54 
 
 		 345 aa  265  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  42.86 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  41.95 
 
 		 347 aa  265  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  42.59 
 
 		 347 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  42.06 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  39.35 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  40.29 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  40.97 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  40.71 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  42.42 
 
 		 346 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  42.33 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  41.28 
 
 		 347 aa  262  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  41.47 
 
 		 344 aa  262  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  42.12 
 
 		 346 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  41.47 
 
 		 344 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  38.79 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  41.18 
 
 		 344 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  45.23 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  41.76 
 
 		 344 aa  260  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  41.26 
 
 		 356 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  41.04 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  40.29 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  39.45 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  39.83 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5093  twitching motility protein  39.14 
 
 		 336 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0372  twitching motility protein  40.67 
 
 		 332 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  40.97 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  40.29 
 
 		 350 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  40.83 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  40.55 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  41.9 
 
 		 345 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  40.69 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  41.57 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  41.57 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  43.2 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  40.54 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  42.17 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5143  twitching motility protein  38.6 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.847516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  37.54 
 
 		 357 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>