More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4635 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  61.82 
 
 		 873 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18301  preprotein translocase subunit SecA  67.97 
 
 		 943 aa  1306    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  46.52 
 
 		 945 aa  780    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0032  preprotein translocase subunit SecA  74.52 
 
 		 935 aa  1448    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  44.95 
 
 		 955 aa  727    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01511  preprotein translocase subunit SecA  69.53 
 
 		 951 aa  1337    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18491  preprotein translocase subunit SecA  68.06 
 
 		 943 aa  1309    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  78.25 
 
 		 930 aa  1528    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36933  predicted protein  57.89 
 
 		 932 aa  1108    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00575996  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  69 
 
 		 942 aa  1308    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1106  preprotein translocase subunit SecA  75.92 
 
 		 935 aa  1439    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7585  preprotein translocase subunit SecA  43.09 
 
 		 928 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.614027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  78.5 
 
 		 930 aa  1533    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  70.66 
 
 		 937 aa  1382    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  70.73 
 
 		 934 aa  1372    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1077  preprotein translocase subunit SecA  75.81 
 
 		 935 aa  1437    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1732  preprotein translocase subunit SecA  67.8 
 
 		 943 aa  1330    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  73.89 
 
 		 948 aa  1445    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  62.28 
 
 		 896 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20951  preprotein translocase subunit SecA  68.37 
 
 		 944 aa  1312    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9327  nuclear-encoded-like protein of plastid sec  45.4 
 
 		 935 aa  744    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3658  preprotein translocase subunit SecA  76.29 
 
 		 932 aa  1483    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  48.25 
 
 		 958 aa  872    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4635  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 936 aa  1922    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08660  protein translocase subunit secA  42.28 
 
 		 901 aa  672    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101262  normal  0.855106 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17671  preprotein translocase subunit SecA  68.96 
 
 		 945 aa  1353    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1246  preprotein translocase, SecA subunit  43.34 
 
 		 968 aa  681    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  45.62 
 
 		 980 aa  756    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  48.46 
 
 		 957 aa  867    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49779  predicted protein  42.69 
 
 		 918 aa  694    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.894811  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18281  preprotein translocase subunit SecA  67.62 
 
 		 943 aa  1328    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  58.79 
 
 		 897 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  60.71 
 
 		 886 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  58.43 
 
 		 899 aa  619  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  58.6 
 
 		 894 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  58.75 
 
 		 903 aa  615  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  56.77 
 
 		 912 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  60.27 
 
 		 888 aa  611  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  59.14 
 
 		 872 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 864 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  56.87 
 
 		 910 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  56.14 
 
 		 899 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  57.86 
 
 		 833 aa  602  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  57.39 
 
 		 994 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  56.82 
 
 		 896 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  57.06 
 
 		 897 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  55.96 
 
 		 993 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  57.79 
 
 		 901 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  59.44 
 
 		 834 aa  589  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  56.92 
 
 		 836 aa  592  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  57.84 
 
 		 896 aa  589  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  59.29 
 
 		 845 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  56.76 
 
 		 866 aa  588  1e-166  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  58.45 
 
 		 968 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  56.29 
 
 		 1067 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  55.87 
 
 		 1018 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  57.88 
 
 		 908 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6305  preprotein translocase subunit SecA  56.48 
 
 		 975 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  57.23 
 
 		 844 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  55.62 
 
 		 954 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  58.95 
 
 		 796 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 931 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 931 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 931 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 931 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 931 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 931 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  56.34 
 
 		 962 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  56.53 
 
 		 962 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 931 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 		 947 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  55.66 
 
 		 944 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  55.53 
 
 		 838 aa  582  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 		 947 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  56.35 
 
 		 858 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  55.11 
 
 		 934 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  56.73 
 
 		 904 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  54.03 
 
 		 932 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  56.54 
 
 		 917 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 930 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  57.82 
 
 		 859 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1387  preprotein translocase subunit SecA  55.3 
 
 		 947 aa  579  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.606945  normal  0.598179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  56.25 
 
 		 962 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  54.03 
 
 		 931 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  56.5 
 
 		 1009 aa  579  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  53.66 
 
 		 932 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  54.03 
 
 		 936 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  53.66 
 
 		 932 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3628  preprotein translocase, SecA subunit  54.36 
 
 		 950 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0804577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  58.66 
 
 		 787 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  54.03 
 
 		 931 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  55.3 
 
 		 862 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  53.09 
 
 		 936 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  56.52 
 
 		 848 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  55.15 
 
 		 840 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  55.34 
 
 		 845 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  54.61 
 
 		 934 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  53.66 
 
 		 932 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  57.17 
 
 		 907 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 907 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>