36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4620 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4620  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2296  hypothetical protein  64.45 
 
 
261 aa  351  8e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.6365  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0013  hypothetical protein  62.75 
 
 
250 aa  332  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1346  hypothetical protein  57.65 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3652  hypothetical protein  59.2 
 
 
255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000420556  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2731  hypothetical protein  54.83 
 
 
259 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3371  hypothetical protein  54.83 
 
 
259 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.515704  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0805  hypothetical protein  47.15 
 
 
248 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05891  hypothetical protein  39.76 
 
 
250 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.791064 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0396  hypothetical protein  40.32 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565727  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10861  hypothetical protein  39.44 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208613 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2567  hypothetical protein  39.92 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2221  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11731  hypothetical protein  39.52 
 
 
246 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.1092 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10841  hypothetical protein  35.5 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1009  hypothetical protein  34.78 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0580203  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10881  hypothetical protein  36.68 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10881  hypothetical protein  34.65 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  31.97 
 
 
440 aa  62  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.11 
 
 
469 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 
227 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  27.04 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  24.43 
 
 
296 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.94 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
367 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  23.44 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  23.35 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.57 
 
 
590 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  23.76 
 
 
423 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.7 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  24.78 
 
 
335 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  28.69 
 
 
356 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  28.23 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  25.4 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2750  beta-lactamase domain protein  21.62 
 
 
237 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
255 aa  42  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>