220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4598 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  100 
 
 		 416 aa  856    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  30.29 
 
 		 995 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  30.53 
 
 		 1058 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1036 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.42 
 
 		 836 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  28.86 
 
 		 570 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.05 
 
 		 950 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  27.61 
 
 		 493 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.8 
 
 		 1432 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1177 aa  99.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.57 
 
 		 974 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  27.36 
 
 		 1020 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1120 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  23.84 
 
 		 562 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  34.16 
 
 		 1257 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  23.94 
 
 		 652 aa  94  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  22.72 
 
 		 557 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  33.99 
 
 		 1244 aa  93.2  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1195 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  32.08 
 
 		 792 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  33.18 
 
 		 1159 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  29 
 
 		 1041 aa  89.7  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  25.3 
 
 		 795 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1147 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  23.24 
 
 		 629 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  24 
 
 		 1231 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1426 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  34.87 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1612 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  29.73 
 
 		 746 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  26.99 
 
 		 694 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1209 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  26.83 
 
 		 1239 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  32.93 
 
 		 816 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  24.8 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1178 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  34.72 
 
 		 1256 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  28.64 
 
 		 1252 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  26.12 
 
 		 1189 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 908 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1154 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  23.14 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.85 
 
 		 1194 aa  71.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1299 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  27.37 
 
 		 684 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.53 
 
 		 1170 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1338 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  22.83 
 
 		 1285 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  37.74 
 
 		 1186 aa  67  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24 
 
 		 1125 aa  66.6  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  22.34 
 
 		 1222 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1209 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  25.69 
 
 		 1132 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  26.72 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  25.31 
 
 		 1076 aa  63.2  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 967 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  25.45 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1282 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  25.82 
 
 		 768 aa  61.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1039 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  49.25 
 
 		 1430 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  27.32 
 
 		 1100 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25.49 
 
 		 1318 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.53 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1231 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  30.82 
 
 		 1089 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1425 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  41.1 
 
 		 1140 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  25 
 
 		 1171 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1104 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  41.1 
 
 		 1131 aa  57  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  34.26 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  25.96 
 
 		 730 aa  56.6  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  23.83 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1484 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  44.93 
 
 		 1144 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1497 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  32.89 
 
 		 1319 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  23.58 
 
 		 882 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  26.89 
 
 		 595 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1440 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1324 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  23.81 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  25.59 
 
 		 535 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  21.76 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  23.69 
 
 		 934 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  28.77 
 
 		 612 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.28 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1210 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  42.86 
 
 		 1180 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  23.44 
 
 		 1038 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  23.74 
 
 		 911 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2478  N-6 DNA methylase  25.84 
 
 		 881 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 834 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  44.93 
 
 		 1162 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  34.19 
 
 		 1359 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25.38 
 
 		 527 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1282 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1241 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>