More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4574 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  100 
 
 
359 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  50.56 
 
 
346 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 
361 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  33.87 
 
 
349 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
358 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
351 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  31.5 
 
 
843 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
314 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
354 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  27.32 
 
 
319 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
347 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
346 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
328 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
342 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
342 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  27.58 
 
 
343 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  25.22 
 
 
328 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  26.82 
 
 
344 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
330 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  27.5 
 
 
355 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  26.76 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.14 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  28.41 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  26.94 
 
 
332 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
328 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  26.89 
 
 
313 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
407 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
367 aa  92.8  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
368 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  25.22 
 
 
328 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  27.04 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  26.21 
 
 
324 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  25.43 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  25.43 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.47 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  23.96 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.6 
 
 
389 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  23.96 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  23.21 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  25.22 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  30.07 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.04 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  24.78 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.21 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  27.47 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  31.78 
 
 
418 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  41.03 
 
 
492 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  35.85 
 
 
645 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  49.23 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  41.89 
 
 
647 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  41.89 
 
 
647 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  50 
 
 
445 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  39.76 
 
 
415 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  47.37 
 
 
451 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  44.93 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  45.45 
 
 
438 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  42.03 
 
 
503 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
563 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  46.43 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.38 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  44.64 
 
 
245 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
510 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  34.29 
 
 
479 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  36.49 
 
 
447 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  41.89 
 
 
448 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  38.16 
 
 
450 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  38.16 
 
 
450 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  33.66 
 
 
537 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  42.86 
 
 
484 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
564 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  53.33 
 
 
628 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  30.93 
 
 
367 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  41.43 
 
 
474 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  23.4 
 
 
340 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.03 
 
 
445 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  48.08 
 
 
556 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  49.09 
 
 
433 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  35.37 
 
 
647 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.62 
 
 
501 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  30.5 
 
 
451 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  38.71 
 
 
508 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  36 
 
 
492 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  50 
 
 
420 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  30.25 
 
 
573 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>