82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4515 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 589 aa  1210    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  40.8 
 
 		 491 aa  346  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  37.77 
 
 		 581 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  36.99 
 
 		 542 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  39.12 
 
 		 550 aa  320  6e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  33.23 
 
 		 593 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.98 
 
 		 539 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  39.48 
 
 		 572 aa  312  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  33.66 
 
 		 591 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  36.79 
 
 		 531 aa  293  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  33.87 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  35.37 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  36.15 
 
 		 581 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  36.15 
 
 		 581 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  32.35 
 
 		 639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  34.37 
 
 		 530 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.96 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  33.79 
 
 		 529 aa  259  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  31.91 
 
 		 563 aa  257  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  34.61 
 
 		 533 aa  257  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  36.09 
 
 		 622 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  32.51 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  33.02 
 
 		 574 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  31.65 
 
 		 624 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  35.7 
 
 		 604 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  31.76 
 
 		 561 aa  237  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  31.8 
 
 		 508 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  30.96 
 
 		 571 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  33.7 
 
 		 550 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  33.69 
 
 		 641 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  29.77 
 
 		 600 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  31.02 
 
 		 518 aa  211  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  31.37 
 
 		 510 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  29.1 
 
 		 531 aa  193  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  31.37 
 
 		 543 aa  191  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  30.69 
 
 		 548 aa  191  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  31.42 
 
 		 645 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  31.88 
 
 		 632 aa  190  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  30.57 
 
 		 606 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  27.64 
 
 		 666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  27.64 
 
 		 666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  30.29 
 
 		 500 aa  181  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  30.06 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  29.33 
 
 		 513 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  30.74 
 
 		 514 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  27.42 
 
 		 555 aa  171  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  28.63 
 
 		 528 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  30.12 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  28.63 
 
 		 518 aa  167  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  29.34 
 
 		 561 aa  166  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  28.6 
 
 		 643 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  28.71 
 
 		 531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  37.61 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  28.04 
 
 		 578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  40.61 
 
 		 629 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  34.98 
 
 		 527 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  35 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  27.77 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  41.79 
 
 		 188 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  32.5 
 
 		 515 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  32 
 
 		 515 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  28.5 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  36.05 
 
 		 261 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  22.49 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.52 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  41.79 
 
 		 262 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  41.79 
 
 		 262 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  22.62 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  26.54 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  23.18 
 
 		 426 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  27.87 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  29.94 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  22.75 
 
 		 390 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  26.23 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  22.84 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  21.3 
 
 		 414 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  21.99 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  24.57 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  34.85 
 
 		 385 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  29.7 
 
 		 932 aa  44.3  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  29.41 
 
 		 416 aa  43.9  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>